GSEA简介 基因集富集分析(GSEA)是一种计算方法,可确定先验定义的基因集是否在统计上显示两种生物学状态之间存在显着一致的差异。来自官网:GSEA[https://www...
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GSEA简介 基因集富集分析(GSEA)是一种计算方法,可确定先验定义的基因集是否在统计上显示两种生物学状态之间存在显着一致的差异。来自官网:GSEA[https://www...
为何要降维?方便可视化探索;减轻维度诅咒;缓解共线性。降维方法:PCA, t-SNE, UMAP, SOM, LLE 1、主成分分析PCA 主成分分析(Principal C...
'patchwork:合并多个R图的包' patchwork是基于gglot2的拼图包,它使得基于ggplot2的图形更容易拼接在同一个图层。 安装 因为作者仅仅在GitHu...
R里面有很多工具包,接收的数据不能直接处理字符串像ggplot2, ggplot(data, aes(x=AAA)),这个的AAA必须是data中的表头。如果你自己提前定义q...
MECAT2是三代测序数据PacBio的高效组装工具,是之前MECAT的改进版, 修复了之前的很多bug, 使用基于string graph的fsa替换了之前的mecat2c...
写在前面 Emmmm,慢慢地发现越来越多 TBtools 用户朋友发表的论文。农学的,医学的,大田的,分子的,湿实验的,数据分析的.... 我可能跟大家有所不同,看到有朋友文...
1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇到类似的分析,通常,我们可以用方差分析判定两组“分布”数据间...
这个需求真的太常见了!注意问题强调的几个关键词:一是快速,二是大量,三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本,比如宏基因组中的物种分析: 方法一:自定义 自定义...