Perl 命令行实战2 - fastq文件的相关操作 注：部分代码可能不太实用，但是可以用来作为perl的单行程序的练习。 本文会不断更新... 目录 fastq文件的介绍前...
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Perl 命令行实战2 - fastq文件的相关操作 -
samtools，bedtools1 samtools • SAM全称是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比对或联配数据的格式。无论是重测序，还是转录组，还是表观组， 几乎所有...
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RNAseq分析流程：从测序Rawdata到Count输出在之前学习snakemake的基础上，这里重新又对之前编写的pipline进行了优化，只需要在config.yaml中输入相应的samples，以及参考基因组路径，即可以得到...
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从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第2节 FASTA和FASTQ在WGS数据的分析过程中，我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式，在这一节中将要介绍的FASTA和FASTQ便是其中之一二。这是我们存储核苷...
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NGS的变异检测高效工具Sentieon使用体验
安装 以目前的20180806为例，下载并解压缩 之后需要将软件的安装位置加入到环境变量PATH中。 此外需要申请一个许可证文件，并且输出一个环境变量SENTIEON_LIC...
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全基因组数据分析完整流程+外显子测序数据分析例子但如果没条件的话，可以尝试利用现有的数据（比如：千人基因组项目，GIAB http://jimb.stanford.edu/giab/等）复现它们的成果，甚至只是构建一个分析...
