多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多倍化，那么在基因组上就会存在一些共线性区域（即两个区域之间的...
发简信
IP属地：河南
-
如何用WGDI进行共线性分析(上) -
如何用WGDI进行共线性分析(中)
Ks可视化 我们在上一篇如何用WGDI进行共线性分析(一)[http://xuzhougeng.top/archives/comparative-genome-analysi...
-
如何用WGDI进行共线性分析(下)
在上一篇教程的最后，我写道「我们能够更加直观的观察到2个peak，基本确定2个多倍化事件」。这里就引出了一个问题，为什么我们可以根据peak来推断多倍化时间？在Lynch和C...
-
如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因型和身高）显著相关的基因位点清晰地展现出来，不少读者朋友应该...
-
sam转bam文件报错
在做BWA比对到参考基因组后，得到sam文件，在进行sam转bam时候遇到一个报错： [W::sam_read1] parse error at line 1 [main_s...
-
跨物种比较（同源基因）
Homolog genes 同源基因是来自一个共同个祖先DNA序列的genes。不同物种中的同源基因指的是直系同源基因（rotholog genes，例如从一个共同祖先基因因...
