比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
IP属地：广东
-
比较基因组学分析2：基因家族收缩与扩张分析 -
提取最长蛋白序列（转录本一样适用）
对于蛋白的fa文件，由于是每个转录本对应一个蛋白序列。由于后期注释需要以基因为单位，因此需要对fa文件进行处理，计算每一个转录本的蛋白序列长度，然后提取最长的蛋白序列，该序列...
-
【JCVI】安装与使用LAST依赖库安装 方法1：手动下载-自行编译 方法2：conda安装 Python版 MCScan安装 初次调用jcvi需要输入JGI的账号和密码： 软件使用 1、从Phy...
-
从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第4节 构建WGS主流程这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读，对于有一定经验的老手来说，相信依然可以有...
-
Augustus安装教程
Augustus是一个使用频率很高的程序，但是安装却麻烦的一批，而且说明书对新手也很不友好； 网上倒是有很多安装的解答，可能是每个机子的情况不太一样，没有一个讲的比较全面的，...
-
GENEWISE 的使用
今天要用到genewise 软件分析数据，记录一下过程！ 1. GeneWise 简介 Genewise主要用于将蛋白质序列和DNA序列进行比对，从而对DNA序列上的编码区进...
-
RepeatModeler安装及使用
如果对重复序列的预测，则使用RepeatModeler，可自身比对进行查找 安装 下载地址：http://www.repeatmasker.org/RepeatModeler...
-
RepeatModeler安装及使用
细节参阅RepeatModele官方文档：http://www.repeatmasker.org/RepeatModeler/RepeatMasker和RepeatModel...
-
使用conda安装RepeatMasker之前使用conda安装RepeatMasker，需要注意以下问题，现在整理一下： 首先使用conda安装软件， 我的conda是装在annotation里的，所以安装好的Re...
