Cell 深度| 一套普遍适用于各类单细胞测序数据集的锚定整合方案 这篇文章说的不是别人，正是Seurat本尊。它正在打破自我的标签，只能做单细胞转录组？只能做CCA寻找共有...
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Seurat 没你想的那么简单||Comprehensive integration of single cell data -
Cytoscape绘制相关网络图导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析，用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 代谢数据：metabo.txt 16S数据：genus.tx...
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R - 相关性分析相关性分析用于评估两个或多个变量之间的关联性。 1. 两个变量的相关性分析 参数相关性检验( parametric correlation ) 皮尔森相关性分析是一种参数相关...
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你的基因名被EXCEL自动转换成数字了吗？
1.充满恶意的Excel自动转换 做基因组学分析时发现，在默认设置下将数据导入Microsoft Excel后，部分基因名会自动转换为日期或浮点1。2016年发表于Genom...
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RNA-seq练习 第二部分（基因组序列下载，注释文件下载，索引下载，比对，比对质控,HTseq-count计数，输出count矩阵文件）参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载，它们分别是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
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转录组学习六（reads计数与标准化）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（reads的比对与samtoo...
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RNA-seq(6): reads计数，合并矩阵并进行注释任务 1.实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表达量文件。2.需要用脚本合并所有的样本为表达矩...
