tidyverse是一个连贯的数据包操作系统,用于数据操作,探索和可视化,具有共同的设计理念。这些主要是由Hadley Wickham自己开发的,但现在正由几个贡献者扩展。T...
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tidyverse是一个连贯的数据包操作系统,用于数据操作,探索和可视化,具有共同的设计理念。这些主要是由Hadley Wickham自己开发的,但现在正由几个贡献者扩展。T...
3.1人类微生物组数据研究的主题和统计假设 目前的微生物组研究主要有两个主题:(1)描述微生物组特征与生物、遗传、临床或实验条件之间的关系;(2)确定与微生物组组成相关的潜在...
2.1 微生物组数据 微生物组数据是通过16SrRNA基因测序和宏基因组测序产生的。生物信息学工具包括QIIME和MOTHUR。例如,在对原始序列进行预处理之后,有两种方式可...
16S rRNA测序和宏基因组测序产生的大量微生物组数据,推动了微生物组研究。数据分析和方法论是微生物组研究的重要组成部分。由于微生物组数据非常复杂,需要发展各种统计方法来进...
10.1 Introduction to Compositional Analysis(成分分析导论) ①什么是成分数据? 根据韦伯斯特第二版新大学词典,作文是“将部分或元素...
在进行回归分析时,通常都是考察多个X对Y的影响,但有时复杂的研究也会涉及研究多个X对多个Y的影响,尤其是数据存在当自变量存在多重共线性问题时,普通的多元线性回归无法很好的解决...
导读 主成分分析(principal component analysis,PCA)是将多个变量通过线性变换以选出较少个数重要变量的一种多元统计分析方法,是常用的数据降维手段...
其实不论是PCoA还是PCA图均是用散点图来展示结果PCoA和PCA的结果,PCoA和PCA准确来讲是数据降维分析方法。顺便值此佳节,祝福各位和“科研”都能够拥有幸福时光和美...
在分析肠道微生物数据中,一般会对数据进行一定的转换,以使数据尽可能的服从正态分布。常用的方法有Centered Log-ratio (CLR) transformation...