你运行代码里序列是对的，参数说明里是错的
Cutadapt去接头软件的安装及用法cutadapt是一款去接头并且也能去低质量碱基的软件。至于接头的产生，一般来说是由于在随机打断时，有些片段的长度过于短，导致插入片段不够，使得测序时会读到测序引物。因此理论...
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2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列质控和生成特征表
文字转载 DADA2是用于检测和校正（如果有可能的话）Illumina扩增序列数据的工作流程。正如在q2-dada2插件中实现的，这个质量控制过程将过滤掉在测序数据中鉴定的任...
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2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列质控和生成特征表
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谢谢你，我一直在找如何检测引物是否存在，并传递参数到下一步。因为有的数据集已经去除引物，有些没有，然而我却不知道哪个去除了。。你的博文给了我思路，感谢！！！
扩增子分析：qiime2平台全流程分析
Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一，其提供...
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制造互联网垃圾 复制粘贴的意义在哪里？
16S扩增子之Vsearch使用
1.概览 2.PE reads拼接（fastq_mergepairs） 3.质量控制（fastx_filter） 去冗余与聚类生成OTUs或降噪生成ASVs（derep_fu...
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检测选择信号/位点本文主要介绍hapFLK(FLK统计量)、LEA软件包(LFMM模型)和PCADAPT软件如何检测选择信号 总体的思想就是通过这几款软件、不同的算法计算出每一个位点的z-sc...
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啥是搜索神技
火山图学习
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张泽民老师系列文章解读(三)说在前面 我们在前两期推文：张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&mid=2247...
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2021-12-15 R 求多个栅格地图叠加后的平均值（时间序列或其他叠加) & 多个栅格地图叠加后的栅格值提取
在对环境因子的数据进行分析时，大多数的全球环境因子数据都是栅格格式的数据，并且按照时间序列或其他格式做成多个栅格数据集。因此 需要对栅格数据集进行求平均值并转化为新的栅格数据...
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2021-12-14 在R中 提取坐标点对应的栅格值
1# 获取点坐标 坐标格式： 2#代码 library(raster) library(rgdal) #导入坐标文件 coor= read.csv(choose.files(...
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GDAL命令行入门## 如果说MIUI是手机界的万物之源，那么在地理信息界，GDAL就是万物之源，即使连ArcGIS和QGIS都是引用它完成基础数据的处理。这开源的好东西，无...
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GDAL 笔记二：python for GDAL
GDAL 笔记二：python for GDAL 介绍 Github上找到的好东西，煮书主要还是覆盖了创建数据类型，统计数据量，转换数据等。 个人感觉基于GDAL的二次开发，...
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Fragstats 部分使用方法STEP1 数据准备 1 地图准备 剪裁好的并赋值好的.tif格式地图 注意：地图的坐标系要设置成投影坐标系， 不要设置成地理坐标系。 因为地理坐标系的图每一个格的像元值太...
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景观比例，物种相对丰度----百分比柱状堆积图STEP.1 数据准备 所有数据储存为.csv格式（个人喜好） A.基本数据 B.分组数据 STEP.2 绘图 library(reshape2) library(ggpl...
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