中国科学院遗传发育所 生物信息学博士<br>专注于基因组组装和群体重测序研究
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GWAS全基因组关联分析：TASSEL 5.0 Windows版软件使用教程TASSEL的官方网站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下载文件夹中......
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杂交群体交换单株筛选方法在使用杂交群体定位QTL的过程中，交换单株的选择是至关重要的。 首先需要明白什么是交换单株。父本植物（基因型为AA）与母本植物（基因型为BB）杂交，得到的F1代含有来自A与B...
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Fine mapping定位QTL作物遗传育种需要发掘对农艺性状有重要贡献的QTL。某一重要农艺性状往往是由多个QTL调控。对这些QTL进行精细定位找出对应的基因对作物的改良具有重要意义。本文对如何进行...
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使用MutMap快速定位突变基因：流程篇
在上一篇文章《使用MutMap快速定位突变基因：原理篇》中，我对MutMap的原理进行的简单的介绍。在本篇教程中，我会对MutMap分析的流程及分析过程中使用到的软件及其参数...
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使用MutMap快速定位突变基因：原理篇缘起 在我的课题中，我们使用了BSA结合全基因组重测序的方法寻找候选基因。本人乃生信小白一枚，可是对生物信息学非常感兴趣，一直想学一些生信分析。索性就以此为切入点，开始了自学...
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基因在染色体上位置可视化感谢CJ大神的反复修改，这个功能越变越好了！本文旨在复现CJ大神推文内容，具体请参考“省心炸鸡”，手动狗头（https://www.jianshu.com/p/b9034ce...
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这谁顶得住😹
说出来你可能不信，我拿TBtools画了个mario
国际惯例 先上图 之前在家的时候干了一件事，就是把08年坏掉的老笔记本的屏幕拆下来，买了个驱动板，然后用一堆微积木做了壳子，变废为宝做了个便携的显示器。微积木搭建壳子的时候接...
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说出来你可能不信，我拿TBtools画了个mario国际惯例 先上图 之前在家的时候干了一件事，就是把08年坏掉的老笔记本的屏幕拆下来，买了个驱动板，然后用一堆微积木做了壳子，变废为宝做了个便携的显示器。微积木搭建壳子的时候接...
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BSA,重测序完整篇重要声明：许多工具、文档是需要爬墙才能看到的，链接无法打开时，可能是被墙了。BSA综述2016年发表0.批量转移文件的方法find ./bwa -name '*2447-20...
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高通量测序数据处理学习记录（五）：上传二代测序数据到GEO前言 实验室最近有一批数据在发表文章之前需要上传到GEO Gene Expression Omnibus。所以记录下上传数据的流程给大家借鉴。 准备 创建NCBI账号 登陆N...
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使用qqman对曼哈顿图（Manhattan plot ）多个显著位点标志不同颜色，拒绝屎一样的绿色
欢迎来到"bio生物信息"的世界 之前的推文GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）写过如...
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使用QTLseqr进行BSA-seq分析QTLseqr是一个用于BSA-seq的R包，它能够读取GATK输出结果进行过滤，最终使用SNP-index和G 统计值的方法进行定位。我们这次尝试使用这个R包来替代我们自己...
