方法常用参数：plt.plot(x, y, 'xxx', label=, linewidth=) 参数1：位置参数，点的横坐标，可迭代对象 参数2：位置参数，点的纵坐标，可迭...
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matplotlib.pyplot.plot 绘制点线图 -
R语言match函数的应用举例
数据筛选是在分析中最常用的步骤，如数据挖掘分析中，从TCGA或GEO得到的表达矩阵要不断筛选，来进行数据整理。match函数是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp...
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ggplot2修改坐标轴默认情况 以下以ToothGrowth数据为例。 修改坐标轴labels的颜色、字体、大小和角度 将坐标轴labels改为粗体、大小为14、45度角度。 删掉坐标轴文本和ti...
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sort配合awk对 GTF文件进行重新排序
Hello，我是倚剑听雨，每日随手更新~带你看生信小白的日常！ 如果你也打算在 hg19的 GTF 文件里添加 tRNA和 rRNA 的数据。 首先，tRNA 数据可以在GE...
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motif分析——从实战到原理（Homer篇）一、不求甚解系列 软件下载及配置 conda安装： conda install -c bioconda homer 使用configureHomer.pl完成HOMER软件的...
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第3篇：用MACS2软件call peaks学习目标： 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Calling Peak calling即利用计算的方法找出ChIP...
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生信格式中的0-base与1-base
CheatSheet 首先先放上 0-based 和 1-based 的cheatsheet FormatTypeUCSC Genome Browser tables（USC...
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正态性检验之qqplot和ppplot原理及R语言实现1. 简单实现qq图 输入为一个vector，我们以a <- seq(1, 250, 1)做为示例数据 利用qqnorm函数直接绘制出了如下正态检验qq图 还可以进一步使用q...
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Seurat4.0系列教程8：细胞周期评分和回归分析我们展示了如何通过基于传统细胞周期相关marker计算细胞周期得分，并在预处理过程中将这些分数从数据中回归，以消除 scRNA-seq 数据中细胞周期异质性的影响。我们在小鼠...
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比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
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10X单细胞（10X空间转录组）之细胞通讯软件之间的分析比较hello，大家好， 这一次给大家分享一下有关各个通讯软件之间的结果是否具有一致性，当然，做细胞通讯的软件非常多了，我也分享了很多，但是分享不是目的，用起来才是我们的终极目的...
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R语言可视化（四十）：网络图绘制40. 网络图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用igraph包绘制网络图 使用ggraph包绘制网络图 使用networkD3包绘制动态网络图
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02 回归算法 - 线性回归求解 θ（最大似然估计求解）回顾线性回归的公式：θ是系数，X是特征，h(x) 是预测值。h(x) = θ0 + θ1x1 + θ2x2 + … + θnxnh(x) = Σ θixi（ i=0~n ...
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基因家族分析(3) ggplot2绘制基因结构图本节我们继续来进行基因家族数据可视化的第3节教程，通过ggplot2绘制一个富有美感的基因结构图&蛋白保守结构域图，喜欢的小伙伴欢迎关注，多多支持，原文链接：https://...
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跟着Nature Genetics学画图：R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色今天推文重复的图来自于 论文Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestica...
