今天分享一篇叶绿体注释工具CPGAVAS2的教程，该教程来自公众号“生信药丸”，原文教程链接：零基础教程 | CPGAVAS2 快速，准确的叶绿体注释工具（附保姆级教程）[h...
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叶绿体注释工具CPGAVAS2 -
Mafft--用于多序列比对最近由于要做phylogenetic tree.所以涉及到了N多软件，包括很多步骤都要重新熟悉。理论上，你有了reads,其实直接用mega就可以满足你的需求，但是有时候上帝...
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用MEGA软件构建NJ树（Neighbor-Joining）MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)— 分子演化遗传分析 MEGA是一款操作简单的系统发育分析软件。 NJ法构建的树...
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测序数据基本信息统计 | reads,coverage,depth
00 写在前面 测序后公司交付数据时，一般会提供质控后的clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理，记得一定要拿回raw data，同时弄清...
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生信小工具专题：BBTools/BBMap Suite 的使用 (1)
不会编程的小白通常会烦恼怎样去处理一些简单的数据统计，不要紧其实日常我们用到百分之80以上的数据统计分析，都已经有人帮我们将轮子造好了，只要我们学会怎样利用好这些工具，很多事...
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MEGA 构建进化树步骤
【转载】 分子进化的研究对象是核酸和蛋白质序列。研究某个基因的进化，是用它的DNA序列，还是翻译后的蛋白质序列呢？序列的选取要遵循以下原则：1）如果DNA序列的两两间的一致度...
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R语言读入比对好的fasta文件然后做NJ树并做boostrap检验今天的推文内容主要参考 https://www.rpubs.com/michelleprem/683962[https://www.rpubs.com/michellepre...
