好久没更了，这半年心情很糟糕，也在不断地调整自己。希望借助更新来转移一下注意力，毕竟啥都没有学到的知识重要~~~ 刚接触微生物组这个领域的时候，就看了Rob Knight的一...
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QIIME2-上游分析
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qc-数据处理与质控
获得原始数据之后，需要对单端序列或双端序列进行引物的去除、序列拼接以及序列质控 Cutadapt 该软件我经常用来切除Primer，甚至切序列也很丝滑 Cutadapt — ...
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qc-数据下载与格式转换
在进行上游分析之前，我们需要进行原始数据的获取，其中就包括去各大数据库下载原始数据 1. 原始数据的下载 wget 批量生成数据链接再下载[https://zhuanlan....
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2022-12-22时间序列分析犹记得大学那会儿，基本上每年寒暑假都要参加数学建模竞赛，书买了不少，题做了不少，但每次只选自己能看得懂的，稍微难一点就糊弄过去甚至是直接放弃，所以到最后仍然是一个代码不会编、...
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2022-12-14判别分析就在大家都在社交平台上各种“阳”言“阳”语的时候，俺不幸地中招了，😂😂😂，俺“杨过”了，但是只希望俺从此以后能够“杨迪”，因为这痛苦的几天真心不想再经历一遍😵😵😵 OK，言归...
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2022-12-09对应分析&典型相关分析对应分析（Correspondence analysis）是因子分析的进一步推广，它是利用降维的思想把R型（对变量或指标）因子分析和Q型（对样本）因子分析统一起来，利用过渡矩...
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2022-12-08聚类分析铛铛铛，好几天没更的我又回来了，没错，俺就是那种组会前发奋努力、组会后疯狂摸鱼的卑微打工人～～～ 今天，要学习的是聚类分析。 聚类分析（Clustering analysis...
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2022-12-04主成分分析多元统计分析（Multivariate statistical analysis）是多变量的统计分析方法，与多元回归分析不同，回归分析是要区分出自变量和因变量，并需要对因变量...
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R语言之相关性热力图最近学习了好几种画相关性热力图的包，为了更好地运用这些包，决定整理一下~~~ 1. GGally包 准确地来说，可以利用该包当中的ggpair()函数来计算相关系数以及绘图，...
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机器学习初步-西瓜书
争取一个月把周志华老师的西瓜书以及课程视频啃完。 1. 绪论 科学是什么、为什么技术怎么做工程做得多快好省应用拓展 机器学习：目前主要研究智能数据分析的理论和方法。 典型的机...
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2022-11-28第五章回归分析使用lm()函数建立多元线性回归模型，使用glm()建立广义线性回归模型。 广义线性模型之泊松回归[https://blog.csdn.net/qq_44638724/art...
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jupyter之IRkernel问题的起因在于我并不是我们组服务器的管理员以及师兄不定期更新base中的R版本，这些都给我造成了很多bug。之前对这些bug视而不见，因为总能够通过一些弯弯绕绕的方法解决，但...
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R语言之数据处理（二）数据属性变换是数据预处理的一种重要方法。接下来介绍几种无量纲化数据预处理的方法。 1.1 数据中心化 数据中心化，是指变量减去它的平均值，即 1.2 数据标准化 数据标准化，...
