本文是参考学习 CNS图表复现03—单细胞区分免疫细胞和肿瘤细胞[https://cloud.tencent.com/developer/article/1702661?fr...
一文了解单细胞对象数据结构/数据格式,单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构, 内容构成,对象的调用、操作,常见函数的应用等。 1. 单细胞seu...
这篇文章我们将介绍从geo数据库下载单细胞测序数据后,多种数据格式多样本情况下,如何读取数据并创建seurat对象。 本文主要结构: 一、数据下载 二、数据读取与seurat...
第四节:细胞聚类分析 在本节教程中,我们将基于批次矫正后的整合数据集进行细胞聚类分析,我们使用PCA线性降维的结果分别执行k-最近邻图聚类,层次聚类和k-均值聚类。 加载所需...
确实很不错
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
鉴于前一段时间有小伙伴私聊 Immugent 说生信宝库是不是专门只写单细胞相关的推文呀,其实,这只是凑巧最近发的都是单细胞相关的。虽然近几年产生了大量的单细胞数据,但bul...
scCancer包是2020年 清华大学Jin Gu团队开发的一个专门用于分析肿瘤单细胞转录组的工具包。它集成了单细胞数据分析的基本流程(Seurat),增添若干适合肿瘤数据...