GSEA分析根据测序公司返回来的分析数据，打开包含所有基因的数据的excel表 在excel 表中先进行部分操作 去除不含EntrezID的行，通过筛选去掉空的列 只保留ge...
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2022-03-20 GSEA 分析（一） -
2022-03-13 GO和KEGG分析（一）---根据韦恩图交集的基因进行分析针对某个基因敲除的斑马鱼，在12-25天会逐渐死亡，因此我们选择了8dpf 和16dpf 的由于进行转录组测序，根据差异基因我们绘制了如下的韦恩图，然后我们需要重点关注灰色区...
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ChatGPT加持的微软New Bing（国内申请与使用）新必应申请 下载安装 Edge dev 版本，这个版本可以直接申请(不用梯子)使用 Edge dev 下载链接：www.microsoftedgeinsider.com/zh...
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bowtie-bowtie2去核糖体RNA一、在NCBI上下载rRNA的fasta序列，用于建立索引 打开NCBI,select “Taxonomy” and search for “sheep“ 点击 Ovis a...
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2020-04-23 绘制Circos图之二 测序深度RNA转录组测序完成后，会进行序列比对，得到的结果是BAM格式的文件。首先将生成的bam文件进行排序， 查看bam文件,格式 hg19.genome数据的分布必须与下图一致 ...
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small RNA学习（一）：GEO数据下载一般在转录组或者基因表达相关的文献中，末尾都会附上Accession Numbers，可以用这个编号在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库上下载该研...
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2021-04-24 分析Reads比对基因组后5和3端的序列情况目的：为了分析基因转录后5‘端和3’端的修饰或添加序列的情况。采用的斑马鱼线粒体基因组为标准序列 将去掉接头的序列文件fq.gz 变为fasta文件格式2.由于fasta文件...
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TRF--Tandem Repeat FinderTRF软件是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件，无需安装，使用简单方便。 1. 重复序列分为串联重复序列和散在重复序列（转座子）； 串联重复序列又包含卫星序列 >...
