轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
发简信
IP属地：西藏
-
单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操 -
Vecyloto.R的安装（碰壁无数次，终于成功）
（文中引用了一些其他作者的教程，如果是不允许转载的请私信告知我，我会立即删除，谢谢）velocyto用于单细胞数据的分析（RNA速率分析）的工具。除了常用的拟时序轨迹分析，R...
-
SCENIC/pySCENIC结果可视化 2022-11-08适用背景 之前写了一篇文章介绍四步完成单细胞数据调控网络流程分析[https://www.jianshu.com/p/71ed43163ce1]，但生成的结果没有进行可视化，...
-
基于剪切速率的拟时序分析单细胞转录组测序 (scRNA-seq)中拟时序分析是很常见的，是用来推断不同的细胞类型间的发育关系，有一类通过RNA速率来推断轨迹的方法，在此介绍一下。 RNA veloc...
-
SCTransform：单细胞样本的标准化Seurat从3.0版本引进了SCTransform这个函数用来对数据做标准化，并且这一个函数可以代替三个函数（NormalizeData, ScaleData, FindV...
-
环境配置笔记12-解决SeuratData包InstallData()无法安装数据集
近期Seurat官网国内上不去，因此在服务器上也无法使用SeuratData包的InstallData()函数，有以下报错： 因此使用自己的电脑在RStudio中下载数据集，...
-
CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概览刘小泽写于19.5.7主要看流程，这一篇不涉及真实数据展示 总的来说，Cell Ranger主要的流程有：拆分数据 mkfastq、细胞定量 count、定量组合 aggr、...
-
单细胞分析之细胞交互-3：CellChat常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
-
ggplot2编写函数来绘图本节来介绍如何编写函数来进行数据可视化，平时画图时我们经常会发现需要编写许多重复的代码来进行绘图，这样不仅使代码冗余也大大降低了代码的可阅读性，因此掌握如何编写函数来简化代码...
个人介绍
Stay Hungry. Stay Foolish
学点R语言，搞点数据挖掘
专注肿瘤研究和学习
ORCID:https://orcid.org/0000-0002-0660-7802
CSDN：https://blog.csdn.net/lijianpeng0302?type=blog 生信小鹏
学点R语言，搞点数据挖掘
专注肿瘤研究和学习
ORCID:https://orcid.org/0000-0002-0660-7802
CSDN：https://blog.csdn.net/lijianpeng0302?type=blog 生信小鹏