下载序列简单不过，无非就是联网NCBI主页，选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载，而且下载的序列是指定的AC或GI的呢？实现这一目的通常办法是借助一些...
IP属地：重庆
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Batch Entrez｜批量从NCBI上下载基因序列 -
利用表达和染色质可及性数据建模基因调控
原文：Modeling gene regulation from paired expression and chromatin accessibility data 引言 ...
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生信 | 构建物种的OrgDb写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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转录组分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
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群体进化-GWAS分析
群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据...
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富集分析后的结果如何画chord弦状图
Chord Diagram弦状图-用来画富集分析的结果 前面看的文献中，有一个很漂亮的圈图，https://mp.weixin.qq.com/s/NIqSTvJ916ZGk_...
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motifmatchr: 在R语言中分析peak中里是否有motif匹配
motifmatchr的作用就是分析众多的序列和众多的motifs, 从中找到哪个序列包含哪个motif. 它的核心函数就是matchMotifs，最大特点就是快，因为它用的...
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2019-06-17 homer motif结果作气泡图
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测序结果概览：基因表达量rank瀑布图，高密度表达相关性散点图，注释特定基因及errorbar的表达相关性散点图绘制这是ggplot2可视化专题的第一个实例操作 ggplot2的基本思路见前文总论：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文目录 【ggplot2绘图具体策略...
