转录因子(Transcription Factors, TFs)指能够以序列特异性方式结合DNA并且调节转录的蛋白质。转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色质和转录，以形...
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Cell重磅综述:关于人类转录因子,你想知道的都在这
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single cell marker 基因数据库在单细胞转录组测序中一个重要的方面就是定义聚类得来的cluster，一个思考的方向就是根据marker基因来定义cluster的细胞类型（cell type）。怎样才能建立c...
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exon,intron,CDs,UTR学习题外话：Python中可通过Lib目录下的idlelib子目录下的idle.pyw或者idle.py进入Python的IDLE界面 DNA中的基因可以分为编码区和非编码区，编...
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Seurat：Integrating stimulated vs. control PBMC datasets to learn cell-type specific responses说明：仅根据官网指南加个人理解，目前官网上发布了3.0版本的指南，下面内容是2.4版本，内容上有些许出入。 整合分析的目的： 1. 鉴定在两种数据集中都存在的细胞类型2. 得...
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单细胞转录组||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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服务器上Rstudio的安装(Rstudio-server)
自己平常在用R/Rstudio本地处理数据或者画图时，因数据量太大（电脑性能太差）而经常卡的不行。前些天突然了解到原来在服务器上也可以装Rstudio，其与本地电脑图形化的界...
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FastQC的基本介绍FastQC的基本介绍: FastQC是一款基于Java的软件，它可以快速地对测序数据进行质量评估，其官网为：http://www.bioinformatics.babrah...
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实验记录10: 用Monocle进行伪时间分析概要 本文主要讨论Seurat对象导入到Monocle中直接进行分析的可行性，分两种情况：①经过数据清洗、标准化和聚类的Seurat对象导入②未经过任何处理的Seurat对象...
