网上流传较广的50道SQL训练，奋斗了不知道多久终于写完了。前18道题的难度依次递增，从19题开始的后半部分算是循环练习和额外function的附加练习，难度恢复到普通状态。...
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50道SQL练习题及答案与详细分析 -
DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fastq。 DNA甲基化及CpG岛定...
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linux 三剑客（awk、sed、grep）
linux 三剑客，处理文本文件三个强大的命令。awk 处理格式文本非常有效率；sed 通过逐行遍历文件，能有效完成文件查找和修改；grep 通过正则表达式匹配，实现文件的模...
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关于学问和知识的有机化对于学问二字，你如何理解？对于读书，你有怎样的看法？对于知识的吸收与消化，你有何看法？对于这些问题的讨论，朱光潜的《人生九论》都有通俗而透彻的解答。那么这篇文章就是自己在阅读...
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Multiqc（转录组分析之质量评估）
fastqc是一款基于java的软件，能够对测序数据的质量进行评估。一个样本生成一个报告，当样本量过多时，逐一查看样本质量就稍显不方便，multiqc是一个基于Python的...
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snakemake 应用介绍
接触到一个生信分析项目，作者基于snakemake 串起了17个用python 脚本编写的分析流程。自己在搭建的Linux 环境下，测试了这些脚本。此文简要介绍snakema...
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经典算法思想2-动态规划动态规划（dynamic programing），通常用于求解具有某种最优性质的问题。动态规划算法与分治法类似，其基本思想也是将待求解问题分解成若干个子问题，先求解子问题，然...
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经典算法思想1-分治算法
分而治之，分治算法（divide and conquer），是计算机科学中非常重要的算法之一。该算法的核心思想可概括为，分解与合并。即把一个复杂的问题分成两个或更多的相同或相...
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5种排序算法的实现（python）
包括冒泡排序、选择排序、插入排序、快速排序和归并排序。前三者的时间复杂度为O（n*n）,后两者的时间复杂度为O（nlogn），两者的基本思想都是分治和递归。 1. 冒泡排序 ...
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[python] ThreadPoolExecutor线程池初识 Python中已经有了threading模块，为什么还需要线程池呢，线程池又是什么东西呢？在介绍线程同步的信号量机制的时候，举得例子是爬虫的例子，需要控制同时爬取的线程...
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单细胞综述之整合分析文章发表于nature review genetics：Integrative single- cell analysis，作者是Tim Stuart与Rahul Satij...
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2019-06-30第三天Seurat v3：Comprehensive Integration of Single-Cell Datatitle：Comprehensive Integration of Single-Cell Data journal：cell IF:36.21 概述：在目前测序进入单细胞...
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【单细胞转录组】monocle 脚本小记文章转自：作者：周运来就是我 链接：https://www.jianshu.com/p/66c387e1de3d 来源：简书 著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非...
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windows 下在NCBI批量下载SRR 数据如果在GEO数据库上一篇文章包括了多个样本，对应到多个SRR run，那么此时一个批量下载SRR 数据的命令就非常方便了。当然，关键在于，你能获得对应的SRR id 或者sr...
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六种方法查看R函数源代码，为啥第三种最惹人喜欢？所谓：操千曲而后晓声，观千剑而后识器。 作为一个开源软件，R的一个非常大的优点就是我们可以随意查看所有算法的源代码，在对这些源代码进行分析的过程中不仅可以加深对算法的认识，而...
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库存分析R语言实现方法通过R脚本实现库存分析的两个内容，一是库存结余量随时间变化的折线图和月同柱状图，二是各个门店库存结余随时间变化的热力图。 R脚本绘制折线图和条形图 R脚本实现门店信息热力图 ...
