每次加载gtf文件时自动闪退是什么问题呢，（gtf文件已经sort并且没有提前建立索引）
IGV展示gff文件1. 加载基因组文件 Genomes➡️Load Genome from File➡️点击自己的基因组 2.加载gtf/gff文件 2.1. Tools➡️Run igvto...
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你好，请问你现在可视化的应该是reads在基因结构的分布情况吧，那怎么可视化call peak后的peaks在基因结构上的分布呢
deeptools可视化
ref1：deeptools辅助CHIP-seq数据分析-可视化 | 生信菜鸟团 ref2：如何使用deeptools处理BAM数据 - 生信技能树 ref3：The too...
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ATAC-seq数据可视化——超简单教程
大家好这里是有时候季更，有时候月更的基因组学研究生。上一期记录了ATAC数据从Fastq数据到bam文件的处理脚本。 ATAC数据一键处理基因组学研究生，公众号：基因组学研究...
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@Bioinfo鱼 --perGroup参数之前我也使用了，绘制的结果图两个重复虽然可以在一个图里了，但我想要的是两个重复数据合并，最终只呈现一条曲线。或者你在分析流程中是怎么处理重复数据的，再次麻烦您。
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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@Bioinfo鱼 可以具体说下用的什么参数吗，是在computeMatrix中合并还是在plotprofile画图的时候合并呢 谢谢
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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你好，请问进行TSS可视化的时候有多个bw重复文件，结果图能把重复合并吗
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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楼主你好，请问我输入多个bw文件，最后能得到一张图里只有一条线而不是多条线吗
deepTools 使用指南
deepTools 是一套基于python开发的工具，适用于有效处理分析高通量测序数据，可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase-seq。 #1. deepT...
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笔记：rmats绘图结果怎么看rmats是一款比较好的分析可变剪切的分析软件，将rmats分析的结果，利用rmats2sashimiplot绘画出的图也是比较漂亮的， 可变剪切事件： 可变剪切事件可以分为...
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ggplot2超详细讲解一.基本概念 "一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attribute...
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中科院硕博生一枚，用简书来记录自己精读paper和学习生信的过程。
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[基因组学]使用biomaRt做水稻ID转换及相关信息的填充
水稻的基因号大致分为两类，一类是RAP号，格式为“Os-Chr-g-number”，另一类是MSU号，格式为“LOC_Os-Chr-g-number”。平时做各种分析时，需要...
