Aji - 简书

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Aji

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zzg_60df

biomaRt基因同源转换时使用中遇到Timeout was reached的解决办法
根据之前别人po文中的代码进行，发现行不通出现了下面这样子的报错：看了下bioconduct上管理员还是谁回复的说是近期biomaRt上有很多下载大量数据的人，导致速度变...

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李艳国

解决RStudio Server: R is taking longer to start than usual
主要原因：当使用RStudio Server处理占内存极大的数据后，长时间不清理内存，不关闭rstudio，可能会产生此种问题，建议计算完毕后，尽快清理内存。当再次打开rs...

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周运来就是我

读《Computational-method-for-single-cell-data-analysis》
跟着运来兄搭建自己的生物信息小书房。趁年轻，读几本硬书，到老了慢慢反刍。如果让我推荐一本比较全面的单细胞数据分析教材，我想会是《Computational-method-f...

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周运来就是我

单细胞数据科学四大过程组两大知识领域与三重境界
很多朋友问是如何保持阅读量的，其实，大部分是之前的存货。有一部分是每有会意，把之前的旧书拿出来再翻一翻，做个导图放上来的。今天，我想和大家分享一点最近对单细胞数据科学的理解，...

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周运来就是我

使用MAESTRO整合分析scRNA和scATAC
Wang, C., Sun, D., Huang, X. et al. Integrative analyses of single-cell transcriptome a...

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Aji

上传数据到GEO数据库获得GEO号
20210106 14:24 参考的教程：Submitting high-throughput sequence data to GEO[https://www.ncbi.n...

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Aji

使用lftp上传数据到GEO，贼快！推荐
我之前在2021年写过上传数据到GEO数据库获得GEO号[https://www.jianshu.com/p/003ef56dd311]，那时候使用ncftpput上传数据，...

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Aji

SCI文章写作以及文章修稿的一点体会
情感: 离上次写笔记快半年之久了，这半年来基本都把心思花在了一个课题上。这两日终于把文章修回去了，静下来心来整理这个课题的结果，想着总结自己这半年来文章写作以及文章修稿的一些...

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周运来就是我

clustree ：聚类可视化利器
我们知道在研究问题时，分组是很重要的，有分组才有故事可讲。比如，两块田一块施肥一块不施肥，可以做比较嘛。在单细胞数据分析中用到较多的数据分组技术是聚类（clustering）...

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