单细胞绘图系列: Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...

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官网:http://subread.sourceforge.net/ 一、原理 文献参考:featureCounts: an efficient general purpos...
bedtools intersect可以对两个基因组特征 (genomic features) 进行overlap,找到两者重合的区域。比如求两个peaks的交集,或者看很多...
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 当我们需要评估ChIP-seq类测序数据的相关性时,deeptools[...
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CellChat三部曲1:使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程,然后R包作者也在B站做了直播介绍,cel...
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事情的起因是我要复现一个文章的堆叠小提琴图,只不过堆叠小提琴用的是Split小提琴图,不仅展示细胞中基因的表达,也将分组展示了。首先堆叠小提琴图Seurat VlnPlot函...