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密码子使用偏性的分析方法介绍DNA通过转录，控制着mRNA的合成，而mRNA是蛋白质合成的模板，它决定了蛋白质的序列结构、功能等信息。把mRNA看作一种语言，它由4种不同碱基的核苷酸组成（A、U、C、G...
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学习密码子偏好性的ENC-plot分析
https://www.jianshu.com/p/acb2736bccc2?tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg 从这个网页来看，需要用R语言的ggplot2...
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植物叶绿体密码子偏好RSCU聚类1.提取cds编码序列略2.计算密码子偏好性用EMBOSS的cusp计算 3.聚类参考（https://www.cnblogs.com/foreverycc/archive/...
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mVISTA 多序列比对叶绿体基因组mVISTA[http://genome.lbl.gov/vista/mvista/about.shtml]可对2个或者多个DNA序列进行比较，可以对比对结果进行可视化。 详...
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REPuter注释叶绿体重复序列REPuter可注释叶绿体重复序列，包括4种类型，Forward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPu...
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进化树加多序列比对结果可视化 | ggtree首先利用mega进行多序列（clustalw）比对然后用最大似然法建树树文件另存为*.nwkclustalw结果另存为fas结尾的fasta格式文件 利用ggtree进行可视...
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你好，我运行时出现了ERROR: MEGAHIT didn't run well
Please check log file : /public3/home/scg5713/data/LBJ/TMLY/LY16/megahit.log这个错误，请问是哪里出错了吗线粒体和叶绿体基因组的组装、注释
组装 GetOrganelle主要用于组装各种质体（叶绿体、线粒体）GetOrganelle github[https://github.com/Kinggerm/GetOr...
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你好，植物线粒体基因的遗传密码是几号呢-o后面的参数为几啊
线粒体组装软件Mitofinder安装与使用
下载与安装如下，官网https://github.com/RemiAllio/MitoFinder[https://github.com/RemiAllio/MitoFind...
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你好，请问植物线粒体基因组的-o参数设置为几呢
线粒体组装软件（1）Mitofinder
软件介绍 听名字就可以猜出来Mitofinder是一个专门用于组装线粒体基因组的软件，该软件运行于liunx平台，不仅可以用于组装线粒体的基因组还可以用于注释线粒体基因组，不...
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重测序分析（1）软件安装
今天开启重测序分析专题啦！恳请各位观众老爷点点关注！ 所有分析均在linux系统上完成整个重测序分析流程涉及到的软件非常多，本节介绍重测序常用软件的安装方法。 安装R包 使用...
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十一. 叶绿体基因组 SNP Calling （bwa, samtools, picard, bcftools, plink）前言 最近分析叶绿体基因组，进行SNP Calling，网上搜到生信药丸[https://www.jianshu.com/u/068665394ccf]的简明教程 " 教程 ...
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使用Aspera上传测序原始数据到NCBI快速上传较大的文件 1. Aspera下载安装 下载地址：https://downloads.asperasoft.com/connect2/[https://downloa...
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将叶绿体基因组上传至NCBI目的 将公司测序并筛选得到的叶绿体基因组上传至NCBI 方法 使用getorganelle,blastn,cpgavvs2,mpi,mega等一系列软件完成有关文件的准备。 ...
