有的时候在做数据分析的时候，会用到各种各样的分析软件，而每个分析软件又有与之相匹配的输入文件格式。格式不对，会很麻烦，有时候会出现错误的结果，甚至就不能运行程序。而许多软件之...
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plink格式文件与vcf格式文件相互转化
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看完这篇Linux基本的操作就会了
前言 只有光头才能变强 这个学期开了Linux的课程了，授课的老师也是比较负责任的一位。总的来说也算是比较系统地学习了一下Linux了~~~ 本文章主要是总结Linux的基础...
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跟着Nature Genetics学作图：使用ggarrange包对ggplot2的多个图进行组合论文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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【报告笔记】提高全基因组选择精度的策略和应用研究这个报告来自扬州大学徐辰武老师，比较系统地总结了他们在GS应用于作物（主要是水稻）方面的研究，值得一看。 动物育种一般只考虑加性效应，而在植物育种中，除了加性效应，往往还需考...
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自己构建物种包OrgDb，然后用clusterProfiler富集分析
利用clusterProfiler进行富集分析时，发现网上没有物种包OrgDb，利用网上教程构建了一个。主要参考了刘小泽的简书，特别感谢一下！！！ emapper首先得到注释...
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FELLA:代谢组学富集分析软件介绍导读 通路富集分析技术对于理解代谢组学数据背后的潜在生物学意义是非常有用的，它们的目的是根据代谢途径中所包含的先验知识，为受影响的代谢物提供上下游关系。然而，对广义代谢通路的...
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非模式生物KEGG富集分析写在前面 因为我研究的物种比较小众，很多注释不完全，R包AnnotationHub中也没有对应信息，所以无法使用公共数据库进行kegg富集分析。所以自己尝试使用KAAS造一个...
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试数据（还是以果蝇为例）。 一、...
