多组学分析之间一定要保证不同组学，以及上下游都使用相同的参考基因组，这次笔记每个物种数据涉及两个组学维度的数据，所有一定要保证这两组学数据用的同一个参考基因组，也就是使用的....
发简信
IP属地：北京
-
Cellranger 多组学构建自己的参考基因组 -
16sRNA 微生物组学分析（一）：从fastq到菌属丰度表16s RNA ：16s rDNA 基因存在于所有细菌的基因组中，具有高度的保守性。 该序列包含9个高变区和10个保守区，通过对某一段高变区序列进行PCR扩增后进行测序，得到...
-
@小橘子_5e3b 可以改的哦，在软件的Style 里
Cytoscape + STRING + cytoHubba 联合使用寻找hub基因
今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操，赶快点起来～ Hub基因（关键基因）是在生物学过程中发挥重要作用的基因，它往往在通路中为主导地位...
-
@e73236e5d7ff 用cytoHubba 筛选一些关键点
Cytoscape + STRING + cytoHubba 联合使用寻找hub基因
今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操，赶快点起来～ Hub基因（关键基因）是在生物学过程中发挥重要作用的基因，它往往在通路中为主导地位...
-
下载TCGA 表达数据并对照表型数据拿到表达矩阵下载TCGA 表达数据并对照表型数据拿到表达矩阵 文章看得多的小伙伴都知道TCGA数据库，大多研究者在文章里都利用过TCGA的数据来验证他们的数据分析结果，所以TCGA数据的...
-
试试把上下调基因分开导入找hub
Cytoscape + STRING + cytoHubba 联合使用寻找hub基因
今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操，赶快点起来～ Hub基因（关键基因）是在生物学过程中发挥重要作用的基因，它往往在通路中为主导地位...
-
Cytoscape + STRING + cytoHubba 联合使用寻找hub基因今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操，赶快点起来～ Hub基因（关键基因）是在生物学过程中发挥重要作用的基因，它往往在通路中为主导地位...
-
单细胞层面剖析癌症靶向治疗中的持久耐药性细胞过去的几十年里，我们见证了治疗癌症——分子靶向治疗的飞速发展和演变，但在靶向癌症治疗中会出现‘持久耐药性’细胞，它一直是影响癌症患者预后的最大挑战。如何消除这些“持久性耐药细...
-
使用R web框架Shiny轻松构建生信交互式网站做生信需要懂 R web框架 Shiny吗？答案：不懂R Shiny的生信科研工作者不是好生信科研者 说说这几年我用web框架参与构建生信网站的项目（就是我搬的砖），1.某病...
-
pbmc_10k_v3.rds 这个rds 的数据来源和数据处理流程在哪里看呢？
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一个扩展功能R包，可以用来分析、解释和探索单细胞染色质数据集。目前，Signac包主要专注于分析单细胞ATAC-seq数据，之后还会添加其他基于染...
-
和楼上同问，你解决了吗？😩
Seurat对象、SingleCellExperiment对象和scanpy对象的转化
Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/conversion_vignette.html[https://satijal...
-
10× Genomics单细胞免疫组库VDJ分析必知必会我们生活着的世界并非只有我们自己，而是有很多小于或大于我们的生物不断与我们交互着，有的让我们开心，有的使我们伤心。这就关系到一个本质的问题： 我是谁？ 我是一个脑袋，一个躯体...
-
为什么我现在访问在页面上没看到“read files”这个功能项
下载ENA数据库文件
ENA数据库：European Nucleotide Archive：隶属EBI (European Bioinformatics Institute)，由 EBI 负责维护...
-
-
-
R画图带中文不显示的解决方法画出的图导出pdf 后图的中文标题和图例不显示，需要加入如图所示的代码，指定标题字体和整个图的字体 中文写出的文件乱码用fileEncoding='uft-8'
