有，请问您当时解决这个问题了吗？
单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
IP属地：山东
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如果有25年在跑的同志们可以参考一下：igraph版本过新会导致和monocle不兼容，到cds >-orderCells(cds)这一步就会报错，后面pseudotime和state可视化跑不出来。这个时候把新版本的igraph卸载掉，加载2.0.3版本就好了
单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操
轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
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星辞_af35 ·
你好，请问同样是pbmc3K数据，同样monocle2按照上述代码运行，为何我降维后拿到的拟时间轨迹只有一个分支，也就是psudotime后得到的root_state只有3个？请问有人有相同情况吗？
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星辞_af35 ·
你好，按照serut-cluster和cell-type的拟时序分析是可以画出来的，可是plot-cell-trajectory(colorby)换成state和pseudotime就报错没有这个对象，想问这个咋解决啊？
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