连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱...
IP属地：黑龙江
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ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS -
重磅干货：外显子的那些疑问
作者：Raymon T编辑：angelica 外显子组分析有助检测出和疾病相关的编码区突变，从而研究DNA变异对正常生物学机制与疾病发病机制的影响。继上篇关于外显子在实验方面...
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R-可视化之颜色与色板选择在用R绘图时，颜色设置是美化过程中不可缺少的一步，这次简单的学习与总结一下。 一、在R中颜色的表示 （1） 颜色的名字 built-in color names R内置了65...
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ROH分析及热点区域计算0写在前面 脚本方面充斥着CHATGPT，复制粘贴。尽管每个步骤都实际运行过，但因为是一边实验一边写，难免存在错误各种排版，细节问题懒得细抠了这篇文章又被锁定了 1.文件处理...
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利用基因组信息改善牲畜 -综述（2019）阅读Michel Georges综述的笔记。这边综述从家畜物种（即牛、绵羊、山羊、猪、家禽和鲑鱼）的可用基因组资源的状况，以及如何使用这些资源来加速缺陷致病基因的发现和管理，...
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2-群体遗传的基础介绍1 易混淆的概念 等位基因（alleles）基因型（genotypes）单倍型（Haplotype）二倍型（Diplotype） 基因座位 VS. 等位基因 两者的区别关键：...
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RNA-seq： 用perl进行基因ID转换RNAseq上游分析得到的矩阵通常是如下的基因id，这对于我们找差异基因不够直观，所以做差异分析之前一般会进行一个基因id转换。 输入文件 即转换为这种格式，方法如下。 输出...
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GeneiASE —— ASE检验
在ASEReadCounter完成位点的覆盖度信息计数统计之后，还需要对位点添加基因ID，随后做二项分布和费舍尔精确检验，这里推荐GENEiase软件。 ASE （等位基因特...
