植物空间转录组分析1:Seurat基本流程 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/4d8b865a8bf7] 植物空间转录...
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了解什么是UMI,什么是barcode,再做分析之前,知道他们是在测序中引入,了解为什么引入即可。 看个简介的视频吧 从了解10X genomics开始陈巍学基因:http:...
1.genome survey 数据过滤去除测序原始数据中可能包含低质量、接头污染以及含 N 过高的 reads NT比对通过BLAST对下机数据过滤后的有效数据进行 NT ...
基因组共线性工具MCScanX使用说明 简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析。。MCscanX有三个核...
可变剪切介绍: 什么是基因的可变剪切? 有些基因的前体mRNA(pre-mRNA)通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接(...
突然间发现大名鼎鼎的R包limma居然有一个函数是alias2Symbol,我看了看它的描述,其功能是Convert Gene Aliases to Official Gen...
SubPhaser原文链接:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[https://nph.onl...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
在RNA-Seq等测序设计中,生物学重复和技术重复,是非常需要注意的问题。 那么问题就来了,生物学重复和技术重复,到底是什么?它们是如何影响我们的实验设计的。 生物学重复(b...