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    特异度(specificity)与灵敏度(sensitivity)

    前言 在论文阅读的过程中,经常遇到使用特异性(specificity)和灵敏度(sensitivity)这两个指标来描述分类器的性能。对这两个指标表示的含有一些模糊,这里查阅...

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    机器学习常见评价指标

    在机器学习或深度学习中,评价指标是衡量一个模型效果好与坏的标准。本文主要介绍一些常用的评价指标,包含:准确率(accuary)、精准率、召回率、F1值、PR曲线、ROC曲线、...

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    分享我的markdown笔记工作流

    Markdown笔记工作流 俗话说的好,“工欲善其事,必先利其器”,优秀的效率工具不仅能显著提高学习工作效率,而且越来越成为创作者不断创作输出的动力。从大一开始接触各式各样的...

  • 核密度图

    核密度估计是用于估计随机变量概率密度函数的一种非参数方法。核密度图不失为一种用来观察连续型变量分布的有效方法。绘制核密度图用到的函数是density()函数。 首先我们用pl...

  • 饼图

    饼图在平时生活中很常见,但是在科研中,相对于饼图,他们更推荐使用条形图或点图,因为相对于面积,人们对长度的判断更精确。也许由于这个原因,R中饼图的选项与其他统计软件相比十分有...

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    Glimmer软件

    1. Glimmer是什么 Glimmer软件采用马尔科夫模型识别微生物中的蛋白编码基因,主要是针对细菌,古菌和病毒。该软件由The Institute for Genomi...

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    reshape2

    1. 安装导入reshape2 2. 认识长数据与宽数据 宽数据是我们常见的数据集格式,因为这种格式符合数据收集的习惯和标准,数据集的每一列为一个观测变量,每一行为一组所有观...

  • R高级数据管理——控制流

    R拥有一般现代编程语言中都有的标准控制结构。在学习控制流之前,应该理解以下概念: 语句(statement)是一条单独的R语句或一组复合语句(包含在花括号{ } 中的一组R语...

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    R高级数据管理——一个实际问题

    本节我们利用所学解决一个实际问题: Q:将学生的各科考试成绩组合为单一的成绩衡量指标进行排名、基于相对名次(以20%为区间标准)给出分段评分、根据学生姓氏和名字的首字母排序。...

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    R高级数据管理——函数

    1.数值与字符处理函数 R语言中数据处理最重要的函数:数值(数学、统计、概率)函数和字符处理函数。 1.1 数学函数 数值(数学、统计、概率)函数用在向量、矩阵、数据框时,单...

  • R初级数据管理——数据集取子集

    数据集取子集 R拥有强大的索引特性,可以用于访问对象中的元素。也可利用这些特性对变量或观测进行选入和排除。 1.选入(保留)变量 数据框中的元素可以通过dataframe[r...

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    R初级数据管理——数据排序与合并

    数据排序 对向量排序 对向量排序主要有三种函数,sort(), rank(), order()函数。下面展示三者的用法:sort()函数直接对函数进行排序,并返回排序结果。 ...

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    R初级数据管理——缺失值NA的处理

    缺失值 在问卷数据或实验数据中,经常会包含由于未作答、设备故障或误编码数据的缘故出现缺失值。在R中,缺失值以符号NA(Not Available,不可用)表示。不可能出现的值...

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    R数据初级管理——变量的创建与重命名

    数据的导入与导出 数据初级管理 创建新变量 表达式由操作符、函数、变量、常量等组成,操作符包括运算操作符和条件操作符。下表展示了常见的运算操作符: 下表展示了常见的逻辑运算符...

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    apply包

    众所周知,当我们利用R语言处理大型数据集时,for循环语句的运算效率非常低。因此在实际应用中,数据处理人员常常利用apply族函数替代for循环以便于在一定程度上提升R语言数...

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    【r<-ggplot2】条形图与线图

    问题 你想要创建基本的条形图与线图 方案 想要使用ggplot2绘制图形,数据必须是一个数据框,而且必须是长格式。 基本图形,离散x-axis 使用条形图,条形的高度通常代表...

  • R数据结构

    R的数据结构 R拥有许多用于存储数据的对象类型,包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。 向量 向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。执行组合功能的函数c()...

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    R包的安装与导入

    R包的安装和使用 R包的安装 R包导入 更新包 显示所有已安装包的信息 显示资源库中所有可以用的R包 移除一系列已经安装的R包 将已经安装的所有R包更新到最新的版本 其他资源...