摘要什么是numpynumpy基础numpy常用方法numpy常用统计方法为什么要学习numpy：1. 快速；2. 方便；3. 科学计算的基础库 numpy是一个在Pytho...
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数据分析-2 numpy -
使用deeptools将bam文件转换为bw文件整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供两个bam转换为bw的命令，分别是bamCove...
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cellranger使用的初步探索（3）cellranger aggr在学习cellranger aggr这一步之前，还是需要再一次复习10x Genomics的测序原理。在cellranger aggr部分，官网（https://suppor...
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R ggplot2 中reorder()如何降序喜大普奔，终于解决了reorder()降序排序的问题；举例说明一下：首先我有两列数据：第一列是样品名，第二列是对应数值。 先画个简单的barplot： 如下图： 我想将x轴排...
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Cellrank：细胞分化轨迹的新秀说在前面 说到细胞分化轨迹的推断，想必很多小伙伴第一会想到的是monocle2这个软件，但是它只能做到oneshot，不能捕捉到细胞分化的动态过程。另一种高阶的算法是RNA速...
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R语言中的full_join、inner_join、left_join和right_join连接
两个dataframe数据之间的连接关系 经常会碰到需要把两个数据进行合并，大的方向有按“列”和按"行"合并两种方式，这里主要讲下按“列”进行合并，如下图，假设有a、b两个数...
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使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第四章)
本文首发于我的个人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顾: 使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章) 使用ArchR分析单细胞ATAC-...
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使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)本文首发于我的个人博客， http://xuzhougeng.top/ 第1章: ArchR基础入门 这一章将会介绍如何导入数据，如何构建Arrow文件，这是后续ArchR分...
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