什么是tibble 简而言之tibble是data.frame的一种形式,语法和data.frame较为相似,其实大部分功能都与data.frame相似。tibble来自于t...
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本期介绍一个控制热图颜色范围并规定指定值颜色的小技巧。 使用的是R语言的pheatmap包,先生成随机数据: data1如下: 查看数据范围: 使用上面的矩阵做热图,要求低值...
前言 首先这里的Origin是不是EA公司游戏发布平台哈。Origin是由OriginLab公司开发的一个科学绘图、数据分析软件,支持各种各样的2D/3D图形。这个款软件上手...
本文转自沈梦圆的博客 全外显子测序是啥?转录组测序是啥?转录组测序又是啥?他们之间有什么差别么?傻傻分不清,不用怕,多学习下就会了,下面让我们一起来看看! 1 温基础测序深度...
VMware中创建的虚拟机无法连接网络时,解决方案如下: 1.首先确保自己的物理机的网络是连通的,在这里不多做介绍。 2. 点击VMware[https://so.csdn....
ggplot2分面作图如果添加注释通常在每一个小图都会添加上比如 如果我只想在第一个小图添加一个注释该如何实现呢?经过搜索找到的办法基本都是为添加注释重新准备单独的一份数据 ...
主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示,箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的,包含6个数据节点,分别表示出数据的上边缘、上...
简介 该数据库包含针对SNP(人类)的两类注释内容: 基于位置关系,给出该SNP位于基因哪个区域(如intronic, intergeni, etc)。如果该SNP与某基因的...
前言 “没有什么比知道我们自己正在做什么更重要了” ——小史,20191121之感触 这...
方法一 基于R包epiR: Tools for the Analysis of Epidemiological Datahttps://cran.r-project.org/...
z-score公式错了哦:
z-score=(up-down)/sqrt(count)
富集分析圈圈图0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图,左图右表。 图的最外层是GOterm的编号,中间灰色背景层表示基因的logFC分布,可以看到每个term对应到的市上调基因还是下调...
选中AI中的对象 ctrl+C复制 打开ppt ctrl+alt+V选择 “图片(增强型图元文件)“ 粘贴(目前尝试发现需要用office,WPS不行) 在ppt中选中粘贴的...
扣除区域: 用方框、圆形、自由选择或者魔棒选择目标区域(tips:魔棒工具图标双击可以调整选择阈值) 按ctrl+T,或者点击edit-selection-add to ma...
1、关于样本含量的问题 logistic回归分析中,到底样本量多大才算够,这一直是个令许多人困惑的问题。尽管有的人从理论角度提出了logistic回归分析中的样本含量估计,但...
clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包,看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档,加上了我的测试数据(还是以果蝇为例)。 一、...
pheatmap交互 最近ComplexHeatmap更新可以将pheatmap对象进行参数转换。新增的ComplexHeatmap::pheatmap()的功能与pheat...
对撞因子 对撞因子(Collider)【1】,在统计学和图模式中,是指同时被两个以上的变量影响的变量,而这些影响对撞因子的变量之间不一定有因果关系。因为在环路图上会显示为有两...
1.用data.frame() 2.先创建矩阵,再转换为数据框 该方法的优势是,当列数很多的时候创建比较方便
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时,都会涉及到 Background; 做分析时,分析工具会提供一些数据供使用者选择或者使用自定义的gene list。 例如,...
分析过程 以rela基因为例,featureCounts结果文件“all.id.txt”中提供的信息为: 接下来用R语言进行分析:1. 提取featureCounts结果中的...