记录下小编自己可能用到的小脚本 (1)fasta转phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq转fast...
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写在前面的废话 这篇文章来自于一个舔狗的悲哀,谨以此文告诉大家莫当舔狗…… 以上聊天记录,就是整个故事背景。当时我的内心历程: 我看过类似的文章欸,赶紧发出来展现一下我的阅读...
之前都是用 fastqc+trimmomatic进行数据质控和过滤,但是fastp更方便也更快,而且可以一次完成质控过滤和出图。 1. Fastp 软件安装 可以直接用con...
参考:生物信息学100个基础问题——第1~ 5题 答案公布 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/34957915] 掌...
1.同物种ID的转换 Gene id 转换(四种基因各种id转换方法)_易易欢欢的博客-CSDN博客_gene id转换[https://blog.csdn.net/weix...
文章:grabseqs: simple downloading of reads and metadata from multiple next-generation seq...
一、压缩和解压缩 1.“.tar.gz”结尾的文件: tar tar -cf newfile.tar file1 file2#将file1,file2文件打包到newfile...
基本流程:数据导入,QC去除低质量细胞,归一化,由于矩阵过于稀疏所以选取top1000~2000,对每个基因进行zscore,线性降维和非线性降维,聚类(基于线性降维的结果进...
1.通配符也叫文件名替换,它主要是作用于匹配文件名,常用命令是ls、find、cp、mv; 2.正则表达式主要是作用于匹配文件中的字符串,常用命令命令是grep、awk、se...