记录下小编自己可能用到的小脚本 （1）fasta转phylip格式 用法：python fa2phy.py seq.fasta seq.phy （2）fastq转fast...
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单细胞ChIP-seq方法的比较写在前面的废话 这篇文章来自于一个舔狗的悲哀，谨以此文告诉大家莫当舔狗…… 以上聊天记录，就是整个故事背景。当时我的内心历程： 我看过类似的文章欸，赶紧发出来展现一下我的阅读...
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fastp：数据质控 + 过滤
之前都是用 fastqc+trimmomatic进行数据质控和过滤，但是fastp更方便也更快，而且可以一次完成质控过滤和出图。 1. Fastp 软件安装 可以直接用con...
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2022-01-27参考：生物信息学100个基础问题——第1~ 5题 答案公布 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/34957915] 掌...
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生信地基系列--生物信息ID的转换
1.同物种ID的转换 Gene id 转换(四种基因各种id转换方法)_易易欢欢的博客-CSDN博客_gene id转换[https://blog.csdn.net/weix...
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grabseqs——批量下载sra数据并直接转换为fastq文件的工具文章：grabseqs: simple downloading of reads and metadata from multiple next-generation seq...
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生信Linux常用命令（更新中）
一、压缩和解压缩 1.“.tar.gz”结尾的文件: tar tar -cf newfile.tar file1 file2#将file1，file2文件打包到newfile...
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2022-07-12 Seurat复习
基本流程：数据导入，QC去除低质量细胞，归一化，由于矩阵过于稀疏所以选取top1000~2000，对每个基因进行zscore，线性降维和非线性降维，聚类（基于线性降维的结果进...
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linux正则表达式学习1.通配符也叫文件名替换，它主要是作用于匹配文件名，常用命令是ls、find、cp、mv； 2.正则表达式主要是作用于匹配文件中的字符串,常用命令命令是grep、awk、se...
