1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后，矩阵默认会变成SCT矩阵，如果不加设置，后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
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单细胞数据处理小细节汇总 -
DESeq2差异分析十全大补使用笔记写在前面：新手老菜鸟，个人心得，不足之处欢迎交流指正；写作不易，转载前请联系我征得同意，谢谢。 1.基本原理 1.1 概述 全称：DESeq2 package for dif...
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WGCNA 挑选软阈值我们今天就搞清楚这两个问题：1.什么是无尺度分布2.手工计算软阈值 无尺度分布 假如我问大家，如果你想认识世界上的任何一个人，需要通过几个人来联系？ 6个。 这个就是6度分隔...
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DiffBand结果差异peaks的width为什么是401？
为什么DiffBand分析所得的差异peaks长度都是401？这个问题一直没找到答案，跟别人的帖子跑的，发现教程的例子peaks的长度不是固定的，找了一些发表的文章中的附表，...
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Picard MarkDuplicates error: Value was put into PairInfoMap more than once
用Picard排序之后标记重复时出现错误： Exception in thread "main" htsjdk.samtools.SAMException: Value wa...
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10.单细胞 RNA-seq：聚类分析学习目标： 评估是否存在聚类过程产生的技术误差 使用 PCA 和 UMAP 图确定聚类质量，并了解何时重新聚类 评估已知的细胞类型标记与假设簇的细胞类型同一性 单细胞 RNA...
