youyi

请问一下差异表达基因要从哪里看呢？

使用ImpluseDE2处理转录组时间序列数据

ImpulseDE2 是一个处理时序数据的R包，用于查找时序数据的差异基因，它可以用来解决两类问题。 Case-only differential expression an...

FengSL

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youyi

想请问一下博主有没有用过bsmap中的-w选项啊，

DNA甲基化数据分析全流程

2021-01-01 更新 简单记录一下平时的分析过程 和RNA-seq前期流程类似 -- 质控、去接头、比对参考基因组、排序 后期就是要提取甲基化位点，包括CpG、CHG、...

生信摆渡

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youyi

请问一下怎么样才能知道是不是链特异性文库呢？

bismark 识别甲基化位点-比对篇

bismark 软件根据序列的比对情况就可以识别甲基化位点，首先需要对基因组建立索引，建好索引之后，就可以开始比对了。 我用的软件自带的单端测序的数据集进行测试， 命令如下 ...

生信修炼手册

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youyi

以数据库模式输入的文件应该怎么输出DMR和DMC呢，write.csv总是有报错

MethylKit 使用手册

methylKit是一个用于分析DNA甲基化测序数据的R包，其核心功能是差异甲基化分析和差异甲基化位点/区域的注释。 1. 加载原始数据 DNA甲基化文件格式如下: 每一行是...

FengSL

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youyi

这个号以后不会更生信学习的内容了。如果顺利的话，年底毕业，我去工作了。下面的话，来自我的毕业论文，想贴出来，在我的博客里面，感谢大家的帮助，感恩遇见，感恩这段岁月。 时光荏苒...