@早睡_01b4 抱歉我很久没有运行这个代码了,也不太记得当时是怎么解决的,看网上也有遇到相同的问题的,不知道能不能解决,https://github.com/YangLab/CLEAR/issues/10
CIRCexplorer3 | 踩坑之路创建circexplorer3环境 python版本需为2.7+ 软件版本问题 注意:Samtools=0.1.18.0,Bowtie=1.0.0.0,tophat=2.0....
@早睡_01b4 抱歉我很久没有运行这个代码了,也不太记得当时是怎么解决的,看网上也有遇到相同的问题的,不知道能不能解决,https://github.com/YangLab/CLEAR/issues/10
CIRCexplorer3 | 踩坑之路创建circexplorer3环境 python版本需为2.7+ 软件版本问题 注意:Samtools=0.1.18.0,Bowtie=1.0.0.0,tophat=2.0....
处理工具 liftOverhttps://gwaslab.com/2021/05/09/liftover-%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%9D%...
项目目的 CIRI2和CIRCexplore,2联合使用对数据进行circRNAs鉴定,并进一步做下游的差异表达等分析。 项目流程 1·tophat,BWA用于map到参考基...
1.下载BWA 2. 解压缩 -j:有bz2属性的-x:解压;-v:显示所有过程 3. 编译BWA 4. 添加到环境变量 在bashrc文件末尾追加export PATH=$...
对于集合的可视化,第一时间想到的都是韦恩图(venn diagram),一般集合不超过5个的时候,可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加,比如说五个的时候,你就很难从图中解...
1 准备bed文件(R) 2 下载坐标转换对应文件,hg38TOhg19 3 下载转换工具 4 进行转换 5 查看结果
导入数据 python读取txt为dataframe[https://blog.csdn.net/Caiqiudan/article/details/112996042] 处...
1. rep()函数 目的: 复制向量或因子函数形式: rep(x, time = , length = , each = ,)参数说明: x:代表的是要复制的对象,可以是...
理论知识: 组织是由不同谱系和亚型的细胞类型组成的复杂环境,每种细胞都有自己独特的转录组。因此,批量转录组分析是细胞类型特异性基因表达的总和加权的细胞类型比例在给定的样本。去...
1,在Python中,一个.py文件就称之为一个模块(Module)2,模块使用优势:(1)提高了代码的可维护性(2)编写代码不必从零开始,可以被其他地方引用(3)可以避免函...
装饰器 1,装饰器定义:在代码运行期间动态增加功能的方式,称之为“装饰器”(Decorator)。本质上,decorator就是一个返回函数的高阶函数。例子:假如要增强sum...
返回函数 1,实例1:可变参数求和(1)即时返回求和结果 (2)返回求和函数,调用该函数则得结果 在函数lazy_sum中又定义了函数sum,并且,内部函数sum可以引用外部...
函数式编程就是一种抽象程度很高的编程范式,纯粹的函数式编程语言编写的函数没有变量,因此,任意一个函数,只要输入是确定的,输出就是确定的,这种纯函数我们称之为没有副作用。而允许...
生成器 1,生成器定义一边循环一边计算的机制,称为生成器,generator。generator保存的是算法。2,生成器的创建(法一)(1)把一个列表生成式的[]改成() (...
迭代 1,迭代定义迭代,Iteration,通过for循环来遍历这个list或tuple,这种遍历我们称为迭代(Iteration)。2,适用对象Python中只要是可迭代对...