DESeq2分析差异基因/ASV时，如果全部基因/ASV都存在0，那么将会因为几何平均数全部为0，导致估算sizefactor失败而报错。 因为默认的计算sizefactor...
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差异分析存在许多含零的行 ｜ Deseq2 -
基于qiime2的扩增子流程写在前面：扩增子在微生物组领域就像分子生物学里面的PCR一样常见、有用，像繁琐的PCR一样（虽然有说明书告诉你引物、Taq酶、dNTPs等的加入量，但是每次都加也很繁琐），扩...
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HISAT2 建立索引警告和比对时报错解决方案
tags： HISAT2 RNA-seq HISAT2 发表的文章中强调了它的速度很快，我就测试了一下这个工具。 HISAT2 建立索引： 然而没多久就看到这样的警告： 只是...
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6.ggplot2——绘制地图6 地图 地图绘制是一项常见的可视化任务，需要用到专门的工具。主要解决两个方面的问题：使用一个数据源绘制地图，以及将另一个信息的数据添加到地图中。 6.1 矢量边界 使用ge...
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R | ggplot2拼图 —— patchwork在Y叔公号（biobabble）看到cowplot乃旧爱，patchwork是新欢[https://mp.weixin.qq.com/s/Y_uK2H7ketmFpJMvkN...
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binmap-123原网址：1）http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2）http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...
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关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...
