背景 随着2017年底MSK和FMI的两个大panel分别获得FDA批准；2018年国外——百时美施贵宝的欧狄沃（CFDA：非小细胞肺癌）、的科瑞达（CFDA：黑色素瘤...
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关于肿瘤突变负荷（TMB）与panel设计--part1 -
[数学建模第五讲] 皮尔逊相关系数皮尔逊相关系数 两种最常用的相关系数：皮尔逊person相关系数和斯皮尔曼spearman等级相关系数。 他可以用来衡量两个变量之间相关性的大小，根据数据满足不同的条件，我们...
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查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点
基础知识 首先我们了解一些基础知识（注：文中图片皆可点击放大查看！）： 启动子（promoter）：与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。转录起始点（TSS）：转录时...
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科研小技巧 | 如何绘制突变mutation/插入Insertion在基因具体外显子/内含子的结构图今天给大家分享一个实用技巧，RT，绘制标注外显子、内含子位置及大小、距离的基因结构图，从而更好地展示你的测序数据的结果，帮助完成下游实验的可视化。 1. 利用Ensembl辅...
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一起看文献吧-菜鸟团一周文献推荐(No.4)
文章题目：Tumor mutation burden and recurrent tumors in hereditary lung cancer 文章链接：https://...
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再见Ubuntu，你好Deepin第一次接触linux就用了很久的Ubuntu，后来尝试了Manjaro、Debian，还是用了Ubuntu，但是用VM虚拟机使用的ubuntu经常卡顿。我始终觉得ubuntu...
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刘小泽学习外显子-三款软件gatk、muse、varscan的结果差异刘小泽写于2020-3-9不涉及软件的具体使用方法，重点在于结果的比较从一个小问题入手不断探索，也是一种不错的学习方式 需要先进行预处理步骤——得到BQSR bam 下面的流...
