引物设计——QPCR 一、序列查找 参考汉恒生物技术文档 常用数据库 NCBI-GeneBank Nucleotide Gene NCBI不多做介绍。NC表示人类基因组DNA...
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使用BRAKER2进行基因组注释(v 2.1.5版)
BRAKER2是一个基因组注释流程，能够组合GeneMark，AUGUSTUS和转录组数据。 在使用软件之前，有几点需要注意下 尽量提供高质量的基因组。目前随着三代测序价格下...
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#每日文献 Day2：NC(黄)-寄生蜂避免重寄生的机制-Neofunctionalization of an ancient domain allows parasites to avoid ...原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-021-25727-9[https://doi.org/10.1038/s41467-021-2572...
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Repeatmasker 安装2021-12-14RepeatMasker配置： 1、TRF TRF（Tandem Repeats Finder）在RepeatMasker安装前必需要提前配置好，这个可以使用conda直接安...
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#每日文献 Day1：MBE（叶）-寄生蜂体型进化机制Comparative Genomics Sheds Light on the Convergent Evolution of Miniaturized Wasps 比较基因...
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Repeatmodeler安装 2021-12-15安装前要先安装好依赖的软件！ 1、RepeatMasker、TRF、RMblast 在正式安装RepeatModeler主程序之前，需要提前配置好其依赖的工具。 2、RECO...
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基因组重复序列检测：RepeatMasker的安装及使用RepeatMasker是重复序列检测的常用工具，通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列，属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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EVM 对预测结果进行整合
从头预测，同源注释和转录组整合都会得到一个预测结果，EVidenceModeler(EVM) 可以对上述结果进整合 软件安装 使用流程 所需数据 gene_predictio...
