使用homer判断A/B compartment 也需要根据TSS文件手动矫正吗?我看homer软件也会考虑TSS啊
AB区室计算【juicer/homer】Tips: 目前主流的计算AB区室工具: juicer/homer/cworld juicer: 第一篇HiC文章实验室提供的工具,计算多个分辨率每个bin的PC1 值,但是...
多换几个镜像试试
day43 失败:conda卡顿无法install 怎么办使用学校服务器安装软件失败为什么会卡顿?明明昨天上午还能用conda install安装,下午在安装htseq的时候,突然就不能用了。conda install htseq之...
本节来介绍一个ggplot2的扩展包gggenomes使用它可以轻松地对不同来源的基因数据组合成一个全面而优雅的图,下面让我们来看一个小例子 安装R包 目前gggenomes...
写的非常棒!iced需要通过pypi
手动安装
HiC-Pro的安装要使用HiC数据就会不可避免的要使用到HiC-Pro,但是HiC-Pro是一个比较难缠的软件,需要安装的东西比较多,会影响的东西比较多,因此我们使用conda建立一个新环境来...
要使用HiC数据就会不可避免的要使用到HiC-Pro,但是HiC-Pro是一个比较难缠的软件,需要安装的东西比较多,会影响的东西比较多,因此我们使用conda建立一个新环境来...
谢谢,学习一下,最近的PPT汇报总被批评
如何在开题、中期和答辩的PPT汇报中理清思路获得老师好评?前面推文提到过我的研究课题并不是十分好,基于此只能就现有的材料了解透彻并尽量做好。开题汇报夸奖PPT讲得好,中期汇报拿到了前几的分数,预答辩得到校外专家的认可。无论是开题,中...
Cool!非常有用,建议多多更新
ATAC-seq差异peaks火山图绘制差异peaks分析是ATAC-seq下游分析中非常重要的一步,可以鉴定出不同样本之间开放程度不同的DARs(Different Accessible Regions),...
差异peaks分析是ATAC-seq下游分析中非常重要的一步,可以鉴定出不同样本之间开放程度不同的DARs(Different Accessible Regions),...
每读一遍都有新的感受
又去读《围城》了围在城里的人想逃出来,城外的人想冲进去,对婚姻也罢,职业也罢,人生的愿望大都如此。——《围城》 不知道有多少人像我一样,对《围城》所有的了解,仅限于“城里人想出去,城外人想进...