pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值（qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value...
IP属地：辽宁
-
生信分析中的p值，q值，padj值和pvalue值
-
【点】p value、FDR、q value
假设检验： 一般步骤： 1.设定假设后需要验证：假设0一般都是“处理组和对照组无区别” 2.构建检验统计量：根据样本数据计算统计量和检验统计量 3.设定置信区间：根据检验统计...
-
【译文】时间序列预测的基本原理本文详细说明了进行时间序列预测的步骤。 我们被随处可见的模式所包围，人们可以注意到四季与天气的关系模式，以交通量计算的交通高峰期的模式，你的心跳或者是股票市场和某些产品的销售...
-
-
sklearn学习笔记——支持向量机SVMSupport Vector Machines scikit-learn中SVM的算法库分为两类，一类是分类的算法库，包括SVC，NuSVC，和LinearSVC 3个类。另...
-
似然比检验 (LR test)计量中检验的一般套路是以 p-value 显著、拒绝原假设为理想情况，然而总有几个检验的假设是不按套路出牌的。Hansen 检验算一个，LR 检验算第二个。 Stata 应用...
-
2021-09-16差异表达基因时的Log2FC和FDR值的含义？转录组分析差异表达[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因时，结果中会出现Log2F...
-
生统笔记1- 差异表达分析中的log2FC和FDRlog2FC log2FC中的FC即 fold change，表示两组样品间表达量的比值，对其取以2为底的对数之后即为log2FC。一般默认取log2FC绝对值大于1为差异基...
-
DESeq2中的似然比检验(LRT)前言 DESeq2的LRT又称之为似然比检验，用于检验跨两个以上组别评估表达变化，比方说以多个时间点作为分组， 似然比检验简介 似然比检验是用于研究你的两个统计学模型是否有差...
-
单变量、双变量和多变量分析之间的区别
单变量分析是数据分析中最简单的形式，其中被分析的数据只包含一个变量。因为它是一个单一的变量，它不处理原因或关系。单变量分析的主要目的是描述数据并找出其中存在的模式。 可以将变...
-
绘制ROC曲线、找截断值的两种软件操作方法如何用SPSS和Medcalc来绘制ROC曲线，并找到截断值。 假设某实验室人员选用一种新方法对同一批患者进行了诊断，患者的真实状态已知。actual代表真实患病状态，即以金...
-
ROC曲线——相关文献实例、原理和绘制方法前言 最近接触到ROC曲线相关的问题，因此下面整理出相关的文章，记录相关原理和应用。 数据分析最让人着迷的一种用途是可以基于现有数据创建能够区分不同类型情景的机器学习预测模型...
-
2021-01-30网络药理学-1
什么是靶点？ 看网络药理学文章里，常常提到活性成分-靶点-疾病。另外2个都好理解，但什么是靶点？药物与机体生物大分子的结合部位即药物靶点，包括受体、酶、离子通道、转运体、免疫...
-
关于P-value，及显著与多重检验校正
P-value：通俗的说就是--犯错误的概率。 在任何一个严谨的科学测量中，我们判断两个数值是否有差异，必须要考虑这个差异可能来源两个方面：可能是真实的差异，也可能来自检测误...
-
-
GO和KEGG富集倍数（Fold Enrichment）如何计算前面我们简单介绍过ggplot2画KEGG富集柱形图[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3...
-
R语言存在NA的p-value计算Summary：t.test计算存在NA值的data时，默认的mean格式为mean(x, na.rm=TRUE), 也就是每组的NA不计入每组的个数中。 验证： 1. da...
-
假设检验 p-value，FDR，q-value
1、p-value 单个假设检验中主要依靠p值(或统计量t)做出是否拒绝零假设H0的决定：p-value和预先设定的检验水准 α 做对比，如果p-value小于等于α，拒绝原...
-
-
Perl 超几何分布计算
1. 超几何分布公式 超几何分布检验在生信中使用是比较多的，典型的就是 GO 和 KEGG Pathway 的富集分析。 超几何分布常用来表示在 N 个物品中有指定商品 M...
