一般做完差异分析都会做这一步,目的是找到差异基因富集到的通路,进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单,这篇笔记里面的代码可以从零搭建一个富集分析工具。 后台回复202...
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一般做完差异分析都会做这一步,目的是找到差异基因富集到的通路,进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单,这篇笔记里面的代码可以从零搭建一个富集分析工具。 后台回复202...
Hands-on Workshop on Computational Biophysics MMBioS workshops[https://mmbios.pitt.edu/...
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蛋白质组知识背景 蛋白质组(proteome):由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质,是一个整体的概念。 蛋白质组学(proteomics):以蛋白...
GNM和ANM的渊源 弹性网络模型 (elastic network model, ENM)将蛋白质的每个残基简化为一个Node, 用其Cα来代替, 残基之间的相互作用简化为...
安装前准备 在上一篇笔记中提到, ProDy 是一个免费开源的 Python 模块,因而可以采用多种 Python 模块的安装方式[https://docs.pyth...
ProDy 简介 ProDy 工具由美国匹兹堡大学Ivet Bahar 实验室[https://www.ccbb.pitt.edu/Faculty/bahar/inde...