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    DAVID富集分析及R语言可视化

    DAVID富集分析 DAVID富集支持多种基因名类型,本次以genesymbol为例 DAVID:https://david.ncifcrf.gov/ 进入之后跟着以下步骤操...

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    利用DAIVD网页进行富集分析,以及结果的可视化展示

    1、进入DAVID网站https://david.ncifcrf.gov/summary.jsp 2、下面实战开始 ①,点击“Upload”,准备上传所感兴趣的基因集 ②,复...

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    转录组差异分析金标准-Limma-voom实战

    刘小泽写于19.3.11Limma作为差异分析的“金标准”最初是应用在芯片数据分析中,voom的功能是为了RNA-Seq的分析产生的。详细探索一下limma的功能吧本次的测试...

  • @NiKasu 你好,请问,我 还是没懂这个40是什么意思呀?刚好我的样本是处理组在前,且首字母在对照组后,那我应该怎么命令呢?求解答~

    13.GEO数据集的R语言差异分析和代码解析--2.差异分析

    一、举例回顾 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中后3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,前3个为正常肾小...

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    DAVID在线功能富集介绍

    我们通过GEO或者其他数据库筛选出了一批显著差异基因,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,我们下一步需要进行GO功能注释和KEGG(pathway)通路富集分析。那么,啥...

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    十一步带你解构GEO分析常规流程(一)

    PDAC数据分析-GSE16515-GPL570 致读者语:本人接下来的九篇GEO解析文章将基于此,不断进行迭代,尝试让核心步骤、让图文与让结构更加美观,让读者与自身更能直击...

  • 我找的一个芯片也是这样的问题,没看到很多那种具体数据,请问您是怎么解决的呢

    GEO数据库视频学习笔记(芯片数据下载和数据读取)

    之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工,再多学一点新知识~这次的笔记是生信技...

  • 您好,新人一枚,想请教一下,带入我自己找的一个芯片,下载的矩阵里没有数据是为什么呢?只有ID号

    12.GEO数据集的R语言差异分析和代码解析—1.数据下载和整理

    一、举例介绍 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,另3个为正常肾小球...

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    R语言绘图包03--火山图EnhancedVolcano

    R语言绘图包系列: R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...

  • @Way青橙 好的,谢谢你啦

    (小学英语)教师资格证无生试讲面试心得

    写在分享前 1月7号参加了小学英语教师资格证无生试讲的面试,非常有冲动想把心得写下来,希望可以分享给需要的同学。原因如下: 大抵原因在于,自己在考试前,其实对于整个面试的过程...

  • 亲,我想问一下,答辩老师提问是英语还是汉语呢

    (小学英语)教师资格证无生试讲面试心得

    写在分享前 1月7号参加了小学英语教师资格证无生试讲的面试,非常有冲动想把心得写下来,希望可以分享给需要的同学。原因如下: 大抵原因在于,自己在考试前,其实对于整个面试的过程...