转成seurat对象后image没了，博主有遇到这个情况嘛
STOmics-seq：Stereopy教程（一）一、背景介绍 大家其实对华大测序的原理什么的都知道，但是以下概念是比较重要的，什么是DNB，bin，我们怎么选择binsize的大小等问题就至关重要了。首先解释以下DNB和b...
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深入解析Seurat整合单细胞数据函数FindIntegrationAnchors 2（CCA和L2正则化算法）hi 各位，今天我们来深入了解一下Seurat做多样本整合的深入算法，CCA算法以及FindIntegrationAnchors函数中的的参数l2.norm 先来知道一下C...
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10x Genomics RNA-seq 原理详解近期的一系列际遇都再次论证了我真的是一个靠运气闯荡江湖的人，鬼使神差的混入了一个超棒的实验室，并且受到了同伴和室友在工作和生活上的无私的照顾。日子像梦一样美好，我只想时间走的...
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单细胞系列课程-10 Trajectory inference analysis of scRNA-seq data视频链接：https://www.youtube.com/watch?v=XmHDexCtjyw&list=PLjiXAZO27elC_xnk7gVNM85I2IQl5BEJ...
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xgboost的原理没你想像的那么难xgboost 已然火爆机器学习圈，相信不少朋友都使用过。要想彻底掌握xgboost，就必须搞懂其内部的模型原理。这样才能将各个参数对应到模型内部，进而理解参数的含义，根据需...
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多元线性回归模型的特征降维：主成分回归和偏最小二乘主成分分析（Principal Component Analysis, PCA） 一个优秀的模型应该是用尽可能少的特征来涵盖尽可能多的信息。对于多元线性回归模型，除了对全部特...
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比例风险(Cox)回归模型——Proportional hazards model
比例风险(Cox)回归模型——Proportional hazards model 引言 比例风险回归模型，又称Cox回归模型，是由英国统计学家D.R.Cox与1972年提出...
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Cox模型方法简要总结参考书目 Applied Survival Analysis: Regression Modeling of Time-to-Event Data, 2nd. (2015)以...
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[富集分析] 3、clusterprofile富集分析--下游可视化1、富集分析的背景知识 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
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单细胞分析中的NormalizeData()与ScaleData()区别在哪儿？今天又是入门单细胞分析的一天在单细胞分析当中，我们会用到两个函数：NormalizeData()和ScaleData()，这两个函数的区别到底在哪儿？它们到底对我们的单细胞数...
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Seurat取子集时会用到的函数和方法在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...
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Seurat绘图函数总结（更新版）更多重要函数见：Seurat重要命令汇总[https://www.jianshu.com/p/104f9290af8b] Seurat绘图函数总结 在使用R语言进行单细胞数据...
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【单细胞测序数据分析-1】认识Seurat对象数据结构/数据格式及操作一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构成，对象的调用、操作，常见函数的应用等。 1. 单细胞seu...
