刘小泽写于2020.5.28Ensemble转Symbol其实不是这么简单，问题百出，需要留意 0 今天遇到一个需求，先来看看 有这样的四个文件，每个文件中都有两列Ensem...
IP属地：北京
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强强联合的基因ID转换 -
error with fastqc and hisat2 in analysis情景 想当年，小白强行按照他人的命令格式循环，致使重命名后翻车乱套。因此，CC师兄教我批量循环，意思是不管id如何，都能使用。一直以来，都是利用循环批量跑转录组数据。这两天，...
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转录组学习六（reads计数与标准化）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（reads的比对与samtoo...
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IQ-TREE的使用 - 超快速用极大似然法构建进化树
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是，常用的快速构建ML树的软件是FastTree，如果要求准确，我会在服务器上使用RaxM...
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系统学习单细胞转录组测序scRNA-Seq(四)刘小泽写于19.3.26陌生的领域就像一张白纸，怎么画就看自己了 前言 关于单细胞测序，我们已经知道了它和bulk RNA-seq的区别，简单说就是scRNA体现异质性（个体...
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【文献】单细胞转录组测序技术与生物信息流程综述【文献】Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines 地址： https://ww...
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OrthoFinder寻找同源基因并建树提到寻找物种之间的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/） ，OrthoMCL是现在用的最多的一款来找直系同...
