火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
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R绘图：ggplot2绘制火山图 -
Adobe Acrobat Pro DC 2022 软件下载安装详细教程软件介绍 Adobe Acrobat Pro DC 2022是一款由Adobe官方推出的PDF编辑和阅读软件，是目前互联网上最专业最优秀的桌面pdf解决方案，它将全球最佳的P...
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PDF文献文档引用插入管理学习&mendeley不念到大二，很少接触到PDF文档。能读到博士，过手或过眼的有大几千份。PDF文档多了，管理起来很麻烦。有些文档从网上下载的时候，很少能有个正常的名字，从新命名并服从管理也是一...
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生信笔记8-基因注释文件
1、简介 注释文件就是基因组的说明书。告诉我们哪些序列是编码蛋白的基因，哪些是非编码基因，外显子、内含子、UTR等的位置等等。注释文件在以下三个提供参考基因组的网站中都有提供...
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R语言1----桑基（sankey diagram）图的绘制--sankeyD3在生信分析或者一些其他的数据分析中，经常会需要绘制桑基图，在这里推荐一个非常nice的R包-sankeyD3（类似于networkD3，但是比其功能更加完善），其出的桑基图比...
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修改stringtie、ballgown 结果中部分gene_id为ref_gene_id
问题：stringtie组装转录本后会改变原本参考基因组注释文件中的gene_id stringtie 组装、merge的stringtie_merged.gtf注释文件中的...
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GATK4流程学习之RNA-Seq variant calling(SNP+INDEL)GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803755fa6]GATK4流程学习之DNA-Seq varia...
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NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
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Hi-C | 基础介绍一、技术原理 基因组研究的维度可以分为很多种，例如下图所示 其中Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于染色体构象捕获（Chromosome Conformatio...
