前言: 蛋白质中功能的基本单元是domain,是一种特殊的三维结构,不同结构的domain与其他分子特异性结合从而发挥功能。与此类似,转录因子在于DNA序列结合时,其结合位点...
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从果子老师的从TCGA数据中提取lncRNA并进行下游分析一文中,我学到了如何从TCGA表达谱数据中提取RNA。老师的教程已经写的很详细了,我再补充一点:如何下载GTF注视文...
Rfam是用来鉴定non-coding RNAs的数据库,常用于注释新的核酸序列或者基因组序列。 infernal说明书:http://eddylab.org/inferna...
介绍 snakemake 原理 建议的框架 Install 用conda在python3环境里安装。 之后,如果python3可以正常用。(which python3)可以被...
cds文件:注释信息里的蛋白编码序列pep文件:cds对应序列翻译成的氨基酸序列从NCBI上下载基因组时,有的并没有上传cds文件和pep文件,此时该怎么办呢? (1)利用脚...
群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis),即主成分分析方法,是一种使用最广泛的数据...
CD-hit 参数解读 -i 设置输入文件 -o 设置输出文件,可以将每次分析的ID阈值放到名称中,方便以后使用,如clean90,就是被清洗后,使用-c 0.90的分析结果...
写在前面的废话 经过这两周意外的断更,我明白了一个道理,人都是具有惯性的…… 两周没写公众号,我似乎都习惯了懒惰,文章不想更了,笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑,一...