这是我第一次写简书上面的文章,为什么这一次提笔想记录一下整个下午自己遇见问题,解决问题的过程,以前都是自己解决完问题记录在有道云笔记上就OK了,今天感觉像这样的过程在以往的科...
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上一篇写的是:重复一篇文献的GWAS(一):基因型数据整理这一篇主要讲GWAS的核心流程和画图。 软件使用参考:使用GEMMA进行复杂性状全基因组关联分析(GWAS)http...
什么情况下需要做正态分布检验 如何检验1. Shapiro-Wilk检验(W检验)2. Kolmogorov-Smirnov正态性检验(D检验)3. Q-Q图法 频率分布直方...
上个月中旬,出于对GWAS的好奇,我参加了一个培训班,之后又花了一周的时间来整理听课笔记,感觉现在对GWAS已经有了一个比较全面的认识。 在call SNP之后,做GWAS之...
前面几节内容,我们了解了在回归分析中,如何判断变量之间的相关性——计算R2,如何判断相关的真实性——计算F值和P值。详情可查看回归概述、线性回归和多元回归其实回归分析的计算理...
DNA测序之mapping介绍 准确度。 基因组很大,并且有重复,如何准确的mapping到基因组。如果比对错误,则会造成假阳性的variant。 敏感性。 有variati...