对于通路分析结果的可视化而言，最常用的展现方式就是在通路中高亮显示富集到的基因。kegg 提供了在Color Pathway 在线服务，可以方便的完成这一任务。 网址如下： ...
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color pathway 使用指南 : 在通路图中标记基因
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KEGG API 用法详解下篇
本篇接着介绍下列 4种 api 的用法： get conv link 4.ddi get 根据提供的kegg 标识符，返回特定的记录，多个标识符之间用+ 连接，一次最多允许1...
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KEGG API 用法详解上篇
对于大多数的数据库而言，API接口可以方便的从数据库中检索数据。kegg 数据库的API 链接如下： http://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi...
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KEGG pathway 数据库
pathway 建立在ko 数据库的基础上，基于我们对生命活动中的分子相互作用和化学物质的反应的认识，构建了复杂的调控网络，采用通路图的形式，进行展示。 通路图中融合了ko,...
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KEGG Glycan 数据库
复合糖作为糖类与蛋白质或者脂质结合的产物 ，在生物中分布广泛，具有重要的功能。GLYCAN 数据库收录了实验验证过的复合糖的信息，主要是结构信息。每条记录用G number ...
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KEGG Genes 数据库
kegg genes 数据库收录了物种的基因信息。 kegg 使用自己定义的ID 唯一区别每个基因，叫做kegg gene ID。 对于每个基因，除了给出对应的物种，染色体...
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KEGG Genome 数据库
kegg Genome 由organisms，selected viruses 和 Metagenomes 3个数据库构成。 kegg Organisms 数据库收录了有完整...
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KEGG Drug 数据库
kegg drug 数据库是一个药物相关信息的综合数据库，包括了在日本，美国，欧洲上市的的药物。所有在日本上市的药物，不论处方药还是非处方药，包括天然药物和中药，都会在Dru...
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KEGG Network 数据库
kegg orthology 数据库是 kegg 的核心，利用基因在不同物种之间的保守性，使得我们可以在更高层次上解读基因功能。 pathway, brite, module...
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KEGG Disease 数据库
kegg disease 数据库收录了已经报告的各种疾病的信息，每个记录用H Number 唯一标识， 比如H00004。 在kegg 中，将疾病视作分子网络的一个不正常的状...
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KEGG Reaction 数据库
KEGG Reaction 是收录酶促反应相关信息的数据库，包含了所有代谢通路中的酶促反应和一些只在enzyme 数据库中有记录的酶促反应，每条记录用R Number 唯一标...
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KEGG Enzyme 数据库
生物体内的大多数反应都需要酶的参与，酶在生命活动中发挥了重要作用。IUBMB/UPAC 国际标准化命名委员会对已经发现的酶都提供了标准化的的命名方式，叫做EC number。...
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KEGG COMPOUND 数据库
kegg compound 数据库存储了在生命活动中发挥作用的各种小分子，生物大分子和其他类型的化学物质，采用C number 进行标识，比如C00047, 代表L-赖氨酸...
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KEGG Orthology 数据库简介
我们经常会使用KEGG数据库来研究基因的功能，而在KEGG 数据库中，直接存储分子功能的就是KEGG Orthology 数据库。 KEGG Orthology 简称KO,该...
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KEGG Brite 数据库
KEGG被称为京都基因组百科全书，是一个综合性的数据库。对于如此庞大的数据库，肯定需要对数据进行分门别类的整理。除了将各种数据拆分到不同的子数据库中之外，KEGG还对所有的数...
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KEGG Module 数据库
具有相同功能的基因被归类到kegg orthology 中，每个KO 代表具体的一个功能。在生命活动中，往往需要多个功能单位共同发挥作用，比如多个蛋白质构成复合体来发挥调控作...
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如何做火一个微博账号这是我在V峰会的演讲内容 分享给大家，恩，没什么好保留的，好的模式，不怕公开 以下是演讲全文： 大家好，我要开始装逼了！ 在座的各位应该都不认识我，就算认识的出了这个门估计也...
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Disease Ontology:人类疾病分类数据库
欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Ontology, 简称GO, 是最常用的基因功能注释数据库之一。Disease Ontolog与GO数据库类似，通过参照MeSH, I...
