好多同学询问孟德尔随机化的问题，我再来尝试着梳理一遍，希望对大家有所帮助，首先看下图1分钟，盯着看将下图印在脑海中： [图片上传失败...(image-9bf17c-1668...
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R数据分析：孟德尔随机化实操
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R数据分析：孟德尔随机化分析文献解析和实例操练
最近抽空研读了一篇探讨高血压和肾功能关系的文献，记录下来分享给大家，主要也是想看看孟德尔随机化的统计分析结果在论文中是如何呈现的，之后我会给大家写写孟德尔随机化的统计分析在R...
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【可视化】R语言ggrepel我们看文献会经常看到上面的图，不管是Gene按照FPKM进行排秩还是ATAC转录因子排秩，还是ChIP的super enhancer排秩，这张图虽然简单，但可以很好的来展示我...
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dplyr包中的inner_join、semi_join、left_join、anti_join、full_join
前⾯面已经介绍过 rbind 和 cbind 函数的⽤用法，如下:rbind : 根据⾏行行进⾏行行合并，就是⾏行行的叠加，m⾏行行的矩阵与n⾏行行的矩阵rbind()最后变...
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TwoSampleMR孟德尔随机化（Mendelian Randomization, MR）是一种利用遗传变异作为工具变量来评估变量之间潜在因果关系的统计方法。这种方法尤其适用于那些难以通过随机对...
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R语言读取xlsx文件
我的博客：我的博客地址[http://www.ikeguang.com/] 关于R语言读取Excel文件，比较麻烦，我从来都反对直接读取xlsx文件，因为爬虫数据时，一般保存...
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R从Excel文件读取数据(xls,xlsx,csv)
R从Excel文件读取数据(xls,xlsx,csv)Reading Data From Excel Files into R 1. readxl package 你可以根据...
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点几下鼠标就可以发一篇5分多的孟德尔随机化SCI纯生信不好发了，还有什么方法不用做实验就可以轻松发表SCI的？肯定是有的，孟德尔随机化就是不用做实验就可以发SCI的一种新发文方法。为什么现在孟德尔随机化会流行起来？主要就是...
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Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析属于Post-GWAS的一项重要工作，旨在GWAS结果的基础上鉴定与表型相关的eQTL和mQTL位点。 传...
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从朴素贝叶斯到贝叶斯网络从朴素贝叶斯到贝叶斯网络 这一段在苦读西瓜书，看到了贝叶斯分类（第七章）后多有感触。作者比较菜，所以总结分析之处的可能多有不当，希望大家可以指出 简介 一说到贝叶斯，第一个想...
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Phenotype : 大规模表型数据处理工具
表型数据的处理，一直是困扰许多同学的问题。面对大规模的表型数据，如果不会编程，纯用Excel的话，往往会消耗大量精力。为了解决大规模表型数据难以处理的问题，小编开发了R包"P...
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贝叶斯共定位软件coloc前言 这篇文章的书写，是受启发于《post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization)》，目的是想了解一下软件coloc是如何巧妙的运用贝叶斯方法...
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post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL...
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TwoSampleMR：两样本孟德尔随机化孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[https://www.jianshu.com/p/8ac31267d3d8] 主要步骤：1. 读取暴露因素GWAS数据选取合适...
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R语言 | （二）R包的安装路径1、R软件中在线下载的包直接默认下载到了c盘，而我安装R在D盘，怎么这种情况吗？ 查看R包的安装位置： 安装 BiocManager 包 安装成功，但没有安装在D盘，安装在C...
