学习某些生物数据分析重要的R包时，极有可能第一步安装R包就被卡住。学习R的过程中也积累了很多R包安装不上的解决方法，希望对大家有所帮助。这里以phyloseq包为例，尝试多种...
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R语言实现Alpha多样性指数的计算
R语言实现Alpha多样性指数的计算 上次我们已经使用R语言来对OTU表的抽平分析，那么我们如何使用抽平后的OTU表来重新计算Alpha多样性呢？接下来我们就来学习一下。 不...
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基于R语言的微生物群落组成多样性分析——物种丰度计算及可视化引言 在对样本的微生物群落组成多样性分析过程中，除了Alpha多样性与Beta多样性的分析，最重要的一个部分就是对样本中微生物具体的群落结构组成情况进行分析。一般我们...
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微生物多样性qiime2分析流程(6) 数据可视化分析(上）在之前的几篇文章里，介绍了如何整合dada2的分析结果，并且已经通过MicrobiotaProcess包转化为了phyloseq对象，接下来先让我们进行一些基础的可视化操作....
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感谢题主～我在下载时遇到了一些问题，在此补充几点哈：1、R和Rstudio的安装路径不可有英文；2、两者安装目录要相同；3、以管理员身份运行Rstudio
R与RStudio的安装
1.什么是R R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。简单来说，R是一门统计计...
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IQ-TREE的使用 - 超快速用极大似然法构建进化树
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是，常用的快速构建ML树的软件是FastTree，如果要求准确，我会在服务器上使用RaxM...
