最近在做蛋白与小分子复合物的动力学模拟，学习了Gromacs的用法，以此记录一下。这里贴出Gromacs的官方文档http://www.mdtutorials.com/gmx...
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Gromacs-蛋白小分子复合物分子动力学模拟实战（包括软件安装） -
Pymol绘制受体与配体相互作用图主要命令color wheat, lig&name C* 将配体C原子设置为小麦色color smudge, !lig&name C* 设置除配体外C原子的颜色hide label...
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利用TBTools分析并可视化基因结构域基因的保守结构域分析是做基因功能验证所必须的分析。通常分析结构域用到的数据库有pfam、NCBI CDD和SMART。本文记录一下通过TBTools一键分析基因结构域并利用工...
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生物学专业必读书目推荐！生物学（biology）是探索生命现象和生命活动规律的科学，是自然科学中的一门基础学科 。其研究对象是生物（包括植物 、动物和微生物 ）的结构、功能、发生和发展规律。 其目的...
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使用Snapgene设计同源重组引物并输出融合载体（Mac、Windows均适用）同源重组是目前最常用的构建载体的方法之一，同源重组的引物设计也有多种方法。今天简单介绍下如何利用SnapGene软件设计同源重组引物。 首先需要准备表达载体序列与目的基因序列...
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R语言数据可视化参考书籍
会不断更新.....https://rkabacoff.github.io/datavis/[https://rkabacoff.github.io/datavis/]htt...
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利用GCpostrun软件分析茶树叶片中蜡质含量主要步骤如下： 1.打开GCMS检测后文件；2.由于加了标样C24，因此样品中最高的峰是C24，查看保留时间，约为27.7左右。即确定了C24的出峰时间； 2.返回C10-C...
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Image J计算叶面积利用 ImageJ测定叶面积 叶面积，是计算比叶面积的必要数据，也是非常重要的植物功能性状。 是一款开源的图像分析软件，广泛应该在生命科学的各领域。 简单记录下利用Image...
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需要科学上网
本氏烟草基因组网站及blast同源基因
本氏烟草在瞬时转化中的运用极为广泛，正好最近在做瞬转，记录一下。 本氏烟草基因组网站https://btiscience.org/our-research/research-...
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Genebank文件.gbk转fasta格式文件
这里用到python中Biopython包完成。 步骤：1.安装Biopython包，在anaconda prompt中使用pip install biopython或在Sp...
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HMMER的安装及使用HMMER是一个软件包，提供了一类被称为轮廓隐马尔可夫模型（此处中文名为直译，英文原称为 profile hidden Markov models, profile HMMs...