本目录为单细胞相关分享索引，持续更新.... 1.上游数据处理 01.单细胞测序上游-数据下载（适用于图形化界面）[https://www.jianshu.com/p/3af...
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13+基因集泛癌分析，中心粒细胞胞外陷阱正火！生信小课堂，全网同名 影响因子：13.751 关于基因集泛癌分析的文章，我们最近也解读过很多目前我们有一些基因集/通路的预分析结果，可以进行深入分析，也可以提供你感兴趣的基因...
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2021-11-16为什么表达矩阵要进行归一化和标准化，因为去除极端值，异常值。原始的raw counts矩阵是一个离散型的变量，离散程度很高。有的基因表达丰度比较高，counts数为100...
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输入两个亲本基因组，输出变异位点，快速开发分子标记引物写在前面 「育种」是目前大多关心的事情。杂交育种仍然是目前最为常用的育种手段。任何方法创新的优异材料，下一步都可能应用于杂交育种。反过来，「基因定位」则是基于杂交群体，开发分...
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miRBase数据库物种名录在非编码RNA的研究中，miRBase是一个重要的数据库。针对非编码RNA（miRNA）进行研究的过程中，需要一个可参考的数据库与测序数据进行比对分析，那么miRBase数据...
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生信技能树：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公众号：优雅R 生物数据分析QA，技术文档与博客，需要你的参与。 ……………………………… 欢迎在简书创作和做笔记的生信学习者、爱好者以及相关编程人员加入本专题，贡献你的文字，无论是原创还是笔记，我们需要你，将本专题打造为生信知识宝库、交流平台。 内容可以是对生物信息学与算法知识相关资源的收集、整理，以及原创笔记： * R * Python * Perl * Linux 工具与编程 * 绘图 * 统计 * 计算生物学 * 各类算法 * 机器学习
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基因组文章 | 买麻藤《Nature Plants》2018
一、研究背景 全世界范围分布超过35万余种的种子植物，包含银杏类、苏铁类、松柏类、买麻藤类和被子植物五大类，买麻藤 Gnetum montanum 是现存裸子植物中唯一的藤本...
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神器 | 计算Non-coding序列选择压！KaKs_Calculator 3.0 重磅发布~写在前面 早前我在 TBtools 中基于NG86逻辑实现 Ka/Ks 计算时走了不少弯路，其中种种，或许只有 Coding 的人才知道。当然，其中还另外牵扯到如何快速进行序...
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可视化！Circos 图绘制，更简单更灵活更方便~写在前面 为什么 TBtools 用起来舒服，相比于不少其他软件，同质非同质的？我想了很久，可能原因之一，即“开发者即用户本身”，简单来说，“我写的软件是就是给自己用的”，而...
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本周最新文献速递20211121
本周最新文献速递20211121 一、精细解读文献 一 文献题目： COVID-19 genetic risk variants are associated with ex...
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circRNA最新文献阅读笔记 2 | CELL | 翻译相关
编者按 几乎是一月一推的，5月29日 CELL Resources 报道了circRNA 在人类心脏翻译的研究进展。 circRNA 翻译研究方法及背景点下面的链接可以快速获...
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一键！构建最大似然树~ 简单又准确写在前面 很多人都知道“建树”，NJ树，最大似然树 - ML，贝叶斯法建树~ 建树的目的常常有两个： 分类 推断演化顺序 其他 - 如分析基因家族扩张收缩等 很多人都会用 m...
